scientific agent skills没有一个所有技能通用的文件支持清单。csv、tsv、json、科学数组、单细胞矩阵和office文档,需要由不同技能及依赖处理。判断前先看具体skill.md的能力矩阵,区分可自动分析、只读部分元数据和仅有格式参考,避免凭扩展名直接套用流程。
通用EDA先看自动处理范围
exploratory-data-analysis的核心工具覆盖CSV、TSV和严格JSON;可选依赖还能检查NPY、NPZ、HDF5、FASTA、FASTQ及部分图片格式,但处理深度各不相同。
HDF5和图片检查主要涉及有限元数据,并不等于完整读取数据内容。该技能默认输入上限为64MiB、硬上限512MiB,还有行数和结构限制;参考目录出现的Excel、Parquet等格式不代表核心工具能直接分析。
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专业数据交给相应领域技能
单细胞数据可按任务使用anndata或scanpy。AnnData原生支持h5ad和Zarr,10X、MTX等还需按具体读取方式和依赖处理。
RDS、Seurat等R对象通常要先经R工具转换成h5ad,再进入Scanpy流程。文件能够打开不代表计数来源、样本标签和数据表示都正确,这些仍要核对。

Office与PDF文本提取另选路径
现有markitdown技能可指导PDF、Office、HTML、CSV等内容转换成Markdown,用于文本分析和检索。它不保证原版式还原,也不是通用的文档编辑器。
扫描件OCR可能需要额外插件或外部服务。2.72.0已不捆绑独立docx、pdf、pptx、xlsx技能,不能把文本转换与完整编辑能力混为一谈。












