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Volcano Engine unterstützt Shenzhen Technology bei der Veröffentlichung des branchenweit ersten molekularen 3D-Vortrainingsmodells Uni-Mol

王林
王林nach vorne
2023-04-13 10:10:131730Durchsuche

Das kontinuierliche Aufkommen neuer Medikamente hat die Lebensqualität des Menschen und die durchschnittliche Lebenserwartung bis zu einem gewissen Grad verbessert. Da es im Bereich des Arzneimitteldesigns Dutzende Millionen Kombinationen von Arzneimittelmolekülen und unterschiedlichen Strukturen gibt, ist der chemische Raum für Arzneimittelkandidaten sehr groß geworden.

Wie können wir die Entwicklung von Arzneimitteln beschleunigen? Shenzhen Technology wurde 2018 gegründet und hat sich zum Ziel gesetzt, künstliche Intelligenz und molekulare Simulationsalgorithmen in Kombination mit fortschrittlichen Computermethoden einzusetzen, um dieses wichtige wissenschaftliche Problem zu lösen.

Herausforderungen molekularer Simulationsalgorithmen

Shenzhen Technology ist ein Praktiker des wissenschaftlichen Forschungsparadigmas „KI für die Wissenschaft“ und entwickelt neue Technologien für die grundlegendste Biomedizin-, Energie-, Material- und Informationswissenschaft sowie die technische Forschung der menschlichen Zivilisation . Eine Plattform für industrielles Design und Simulation im Mikromaßstab der ersten Generation.

Dieses High-Tech-Unternehmen verfügt über starke wissenschaftliche Forschung und industrielle Umsetzungsfähigkeiten. Im Bereich der Medizin beispielsweise kombiniert Shenzhen Technology die Theorie der Störung der freien Energie, Molekulardynamik, verbesserte Probenahmealgorithmen mit Hochleistungsrechnen durch Hermite Uni-FEP, Uni-Fold, RiD und andere Module, um Proteinstruktur und Konformationsänderungen genau vorherzusagen . und bewerten Sie die freie Bindungsenergie von Proteinen und Liganden effizient mit chemischer Präzision, bieten Sie Arzneimittelentwicklern effiziente und genaue theoretische Anleitungen und verbessern Sie die Effizienz des Arzneimitteldesigns und der Arzneimitteloptimierung.

Aufgrund der linearen Abhängigkeit molekularer Simulationsalgorithmen von Ressourcen wie der Rechenleistung ist Shenzhen Technology hinsichtlich der zugrunde liegenden Ressourcenplanung und Algorithmusoptimierung auf die folgenden Herausforderungen gestoßen:

  1. Die Anzahl der Rechenvorgänge Die Aufgaben sind groß und die Schwankungen sind groß. Die zugrunde liegende Plattform muss flexible und effiziente Planungsfunktionen bieten. Großes Modell, großes Speichertraining
  2. Shenzhen Technology Entscheiden Sie sich für eine Zusammenarbeit mit Volcano Engine, um effiziente, zuverlässige und flexible Hochleistungs-Computing-Dienste zu erhalten. Das branchenweit erste molekulare 3D-Pre-Training-Modell
  3. Die Volcano Engine bietet Shenzhen Technology eine GPU-beschleunigte wissenschaftliche Rechenlösung, die automatisch und elastisch entsprechend dem Geschäftsverkehr erweitert werden kann und automatisch den Gesundheitszustand jedes einzelnen Modells erfasst Knoten und formulieren Sie eine entsprechende Selbstheilungsstrategie, um einen intelligenten Betrieb und eine intelligente Wartung zu erreichen. Wenn beispielsweise ein Knoten nicht verfügbar ist, kann diese Lösung die Container auf dem Knoten ersetzen und neu planen, um den reibungslosen und gesunden Betrieb des Unternehmens sicherzustellen.

Die wissenschaftliche Computerlösung basiert auf den Cloud-Basisprodukten von Volcano Engine, um eine elastisch skalierbare, beschleunigte Computer-Server-GPU bereitzustellen, leistungsstarke Dateidienst-Cluster und parallele Dateispeicherung mit extrem hohem gleichzeitigem Durchsatz bereitzustellen und die Anforderungen zu erfüllen Die Plattform für maschinelles Lernen, die speziell für Hochleistungs-Computing-Szenarien wie KI und wissenschaftliches Rechnen entwickelt wurde, ermöglicht es Shenzhen Technology, sich auf die Kerngeschäftsentwicklung zu konzentrieren.

Der zuständige Verantwortliche von Shenzhen Technology sagte: „Nachdem wir wissenschaftliche Computerlösungen eingesetzt haben, können wir uns auf die Entwicklung der Anwendung selbst konzentrieren, ohne die Infrastruktur wie zugrunde liegende Server direkt zu kaufen und zu verwalten, wodurch die IT-Wartungskosten effektiv gesenkt werden.“ Die wissenschaftliche Computerlösung Volcano Engine garantiert effektiv den Forschungs- und Entwicklungsfortschritt von Shenzhen Technology. Kürzlich veröffentlichte Shenshi Technology das erste dreidimensionale molekulare Pre-Training-Modell Uni-Mol (https://github.com/dptech-corp/Uni-Mol).

Volcano Engine unterstützt Shenzhen Technology bei der Veröffentlichung des branchenweit ersten molekularen 3D-Vortrainingsmodells Uni-Mol

Schematische Darstellung des Uni-Mol-Frameworks

Uni-Mol verwendet direkt die dreidimensionale Molekülstruktur als Modelleingabe, anstatt eindimensionale Sequenzen oder zweidimensionale Graphstrukturen zu verwenden. Das auf dreidimensionalen Informationen basierende Repräsentationslernen ermöglicht es Uni-Mol, SOTA (Stand der Technik) bei fast allen nachgelagerten Aufgaben im Zusammenhang mit Arzneimittelmolekülen und Proteintaschen zu übertreffen. Außerdem kann Uni-Mol damit verbundene Aufgaben zur molekularen Konformation direkt abschließen 3D-Konformationsgenerierung wie die Vorhersage der Protein-Ligand-Bindungskonformation und übertrifft bestehende Lösungen.

In Zukunft wird Shenzhen Technology auch eine Reihe von Berechnungsfunktionen für proteinfreie und absolute freie Energie auf Basis der Volcano Engine-Plattform einführen, um der Branche innovative, fortschrittliche Produktivitätstools zur Verfügung zu stellen und die Entwicklung von Medikamenten und anderem zu beschleunigen Entwürfe.

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