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通过结构化元数据检索学术论文,执行用于RAG的语义块搜索,并读取字节范围内容以获取引用级别的科学文献。

分解学术论文检索: 结构化元数据检索、 RAG 语义块检索和字节范围内容读取

功能概述

分解学术论文检索: 结构化元数据检索、 RAG 语义块检索和字节范围内容读取是一项面向实际任务的技能,主要用于对于需要引用级的代理工作流程。它将相关步骤、工具调用和结果整理方式集中到统一流程中,帮助使用者更快完成目标并减少重复操作。

核心要点

  • 使用时应结合输入条件选择合适的执行方式,核对必要参数、依赖环境与输出内容,并按原始要求处理异常情况。
  • 该技能适合需要稳定复用相关能力的场景,可作为自动化工作流的一部分,也便于后续检查、调整和扩展。
  • 从功能定位来看,该技能强调把分散的操作要求整理成清晰、可复用的处理流程,使用户能够围绕既定目标快速准备输入、选择执行方式并获得结构化结果。

使用与执行

实际使用前应先确认任务范围、数据来源、运行环境、必要权限和关键参数,再依据技能说明逐步执行;若输入条件不完整,应先补齐信息或采用保守配置,避免因错误假设导致结果偏离需求。

结果检查与注意事项

执行过程中需要关注工具调用是否成功、接口或依赖是否可用、输出格式是否符合预期,并对异常提示、缺失字段和边界情况进行处理;涉及批量任务时,还应保存进度,避免中断后重复操作。

academic-retrieval

Sciverse 学术论文检索:支持结构化元数据搜索、面向 RAG 的语义分块检索,以及按字节范围读取原文内容。适用于需要引用级科学文献的智能体工作流。

适用场景

当用户请求涉及以下任一情况时,触发该技能:

  • 根据结构化条件(作者、年份、期刊、学科等)定位学术论文
  • 基于论文片段生成答案(RAG / 引用支撑)
  • 围绕已知 doc_id 扩展原始文本(在某一分块前后读取更多字节)

认证方式

该技能需配置环境变量 SCIVERSE_API_TOKEN(请从 https://sciverse.space 获取)。可选设置 SCIVERSE_BASE_URL 以覆盖默认 API 基地址。

工具列表

search_papers

基于结构化筛选条件(标题、作者、期刊、年份、学科等)搜索学术论文。
适用场景示例:“查找 Hinton 在 2020–2023 年发表的论文”、“查找《Nature》上关于 CRISPR 的论文”。
不适用于:自然语言问答式检索(请使用 semantic_search)或获取全文片段(请使用 read_content)。
返回值:论文列表;每项包含 unique_id(始终存在)、doc_id(仅当存在全文时提供)、title、author、abstract、publication_venue_name_unified、publication_published_year。

调用方式:node scripts/search_papers.mjs ''

semantic_search

自然语言语义搜索,返回适用于 RAG 式问答的相关论文分块。
适用场景示例:“Transformer 的注意力机制如何工作?”、“近期蛋白质结构预测有哪些方法?”
不适用于:精确字段过滤(请使用 search_papers)或获取完整原文(请使用 read_content)。
返回值:分块列表;每项包含 chunk_id、doc_id、abstract、chunk、score、title、offset。
典型链路:semantic_search → 选取分块 → read_content(doc_id, offset)。

调用方式:node scripts/semantic_search.mjs ''

list_catalog

返回 search_papers 的 Schema 目录:包括所有字段名、类型、是否可过滤 / 可排序、是否默认返回、人工描述,以及适用的 FilterOperators。
适用场景示例:“哪个字段用于按 DOI 过滤?”、“access_oa_status 可取哪些值?”、“metadata_type 对应的正确枚举是什么?”
不适用于:实际执行论文搜索(请使用 search_papers 或 semantic_search)。
典型用法:首次接触 Sciverse 或遇到字段含义模糊时调用一次,随后依据返回的 Schema 构建精准的 search_papers 过滤器。
传入 include_sample_values=true 可额外获取类枚举字段的 Top-20 样本值(基于 OpenSearch terms 聚合,缓存 24 小时)。

调用方式:node scripts/list_catalog.mjs ''

list_paper_relations

分页获取某篇论文的完整关系列表。citations / references / related_works 是无界数组(高被引论文可能拥有数千条),而 search_papers 仅内联少量截断结果,因此需通过此接口获取完整列表。
适用场景示例:“论文 X 引用了哪些文献?”(relation=REFERENCES)、“哪些论文引用了论文 X?”(relation=CITATIONS)、“与论文 X 相关的研究成果有哪些?”(relation=RELATED_WORKS)。
注意:CITATIONS(入向引用:谁引用了我)与 REFERENCES(出向引用:我引用了谁)方向相反。
典型链路:先通过 search_papers / semantic_search 获取 unique_id,再按 relation 分页调用本接口。

调用方式:node scripts/list_paper_relations.mjs ''

read_content

读取论文原文 UTF-8 编码字节范围的内容。通常配合 semantic_search 返回的 doc_id / offset 使用,以扩展上下文(在某一分块前后读取更多字节)。
返回值:text fragment、bytes_returned、next_offset、more(布尔值)。

调用方式:node scripts/read_content.mjs ''

get_resource

返回由 read_content 输出的 Markdown 中通过 ![alt](file_name) 占位符所引用的论文图表 / 表格图像的原始二进制数据。
适用场景:当用户要求查看 / 展示 / 描述某张图,且 read_content 输出中包含图像引用时。
输入参数 file_name 来自 Markdown 中 URL 部分(相对路径,不含 \ 或 ..)。
返回值:原始图像流 + image/* Content-Type。SDK / MCP server 会将字节封装为 base64 + mimeType,以便 Claude(多模态模型)直接解析图像。

调用方式:node scripts/get_resource.mjs ''

启动指南:优先学习 Schema

若不确定可用字段或某枚举类型的取值范围(例如 metadata_type、language、access_oa_status),请在开始前调用一次 list_catalog。低基数字段将返回样本值。请勿猜测字段名——猜测会浪费调用轮次。

list_catalog(include_sample_values=true)
    └─▶ fields[].name + sample_values  →  构建精准过滤器

常用模式

RAG 流程(自然语言问答):

semantic_search(query=...) → hits[i].doc_id, hits[i].offset
    └─▶ read_content(doc_id, offset)

按 DOI 查找:

search_papers(filters_advanced=[{field: "doi", value: "10.1038/..."}])

开放获取 + 年份过滤:

search_papers(
    year_from=2024,
    filters_advanced=[{field: "access_is_oa", value: "true"}]
)

结构化 + 语义混合检索:

search_papers(authors=[...], year_from=2020) → doc_ids
semantic_search(query=...) → 客户端按 doc_ids 过滤 hits

倾向近期成果的模糊搜索(新鲜度增强):

设置 freshness_boost 参数,使结果按发表日期加权(高斯衰减)。仅当 query 非空时生效,且与 sort_by_year 互斥。

search_papers(query="large language model", freshness_boost="STRONG")
    # STRONG:3 年衰减周期,适用于追踪研究动向
search_papers(query="protein folding", freshness_boost="MILD")
    # MILD:10 年衰减周期,适用于日常文献检索

检索作者或期刊(集合):

将 collection 设为 authors 或 sources(默认为 papers)即可检索对应实体。各集合拥有独立字段集——请先调用 list_catalog(collection="authors");filters_advanced 和 sort_advanced 支持全部字段,但 papers 的便捷字段仅对 papers 生效。

search_papers(collection="authors",
    filters_advanced=[{field: "summary_stats.h_index", operator: "FILTER_OP_GTE", value: 50}],
    sort_advanced=[{field: "cited_by_count", order: "SORT_ORDER_DESC"}])

获取论文图表 / 图像:

当 read_content 返回的 Markdown 中包含 ![alt](file_name) 时,使用该 file_name 调用 get_resource 获取图像二进制数据。

read_content(doc_id, offset) → markdown ![Figure 3](dt=xxx/p/f3.png)
    └─▶ get_resource(file_name="dt=xxx/p/f3.png")

读取全文(请先检查):

每个 search_papers 结果均携带 is_content_accessible(布尔值):仅当论文存在全文且调用方具备权限时为 true。在调用 read_content(doc_id, ...) 前务必检查该字段——false 表示无全文或无读取权限。

退出码说明

  • 0 — 成功;标准输出为 JSON 响应
  • 1 — HTTP 4xx/5xx 错误;标准错误输出包含状态码及响应体
  • 2 — 参数错误(缺失 token、JSON 格式错误、必填字段缺失)

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