答案：以everything为主语的反义疑问句用it代替，遵循前肯后否或前否后肯原则，如everything is ready, isn't it？；not everything表示部分否定，意为“并非所有”，不同于nothing的完全否定；everything可用于疑问句（如how is everything?）和否定句（如money isn't everything），表达整体关切或抽象否定，需依语境判断使用。
如果您在学习英语语法时遇到以"everything"为主语的反义疑问句，不清楚其构成规则和与否定词搭配时的逻辑含义，则可能是由于混淆了代词指代规则和部分否定用法。以下是解决此问题的步骤：
一、掌握反义疑问句的基本结构
当主语是"everything"这类不定代词时，反义疑问句的附加问句必须使用中性代词"it"来指代，并且时态需与主句保持一致。这是由语法规则决定的固定搭配。
1、确认主句谓语动词的时态和形式，例如"is"、"was"或"has been"等。
2、根据主句的肯定或否定状态确定附加问句的否定或肯定形式，遵循“前肯后否，前否后肯”原则。
3、将主语"everything"替换为"it"，构成完整的附加问句。例如，"Everything is ready"的反义疑问句为isn't it?
二、区分部分否定与完全否定
"everything"与否定词连用时会产生部分否定，即并非全部，仍有部分成立。这与使用"anything"构成的完全否定有本质区别，需通过上下文准确理解语义。
1、识别句子中的否定词，如"not"、"never"或"no"等。
2、分析"not everything"结构，明确其意为“不是所有……都”，表示整体中存在例外。例如，"Not everything is true"意为并非所有事情都是真的。
3、避免将其误解为完全否定，切勿与"nothing"或"not anything"（相当于nothing）混淆。
三、正确使用everything在疑问句和否定句中的形式
尽管传统教学强调疑问句和否定句中多用"anything"，但"everything"在特定语境下也可用于疑问句和否定句，表达对整体状况的关切或进行抽象否定。
1、在询问整体情况的固定表达中使用"everything"，例如"How is everything?"，意为一切都好吗？
2、在否定句中使用"everything"以表达抽象或哲学意义上的否定，例如"Money isn't everything"，意为金钱不是一切。
3、避免生搬硬套规则，应根据具体语境判断是否可以使用"everything"而非强制替换为"anything"。
