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Wie implementiert man mit Python einen genetischen Algorithmus zur Lösung des Traveling Salesman Problem (TSP)?
- WBOYnach vorne
- 2023-05-08 19:46:182551Durchsuche
TSPproblem
Bevor wir also beginnen, beschreiben wir dieses TSP-Problem im Detail. Freunde, die sich mit digitaler Modellierung beschäftigt haben oder mit intelligenter Optimierung oder maschinellem Lernen in Berührung gekommen sind, sollten dies alle wissen. Um die allgemeine Zielgruppe dieses Artikels zu erreichen, werden wir natürlich unser Bestes geben, um ihn so perfekt und klar wie möglich zu gestalten hier, damit wir das Problem tatsächlich lösen können.
Dann ist die Frage eigentlich einfach, sie geht so:
In unserer N-dimensionalen Ebene befinden wir uns heute Die Wörter basieren auf dieser zweidimensionalen Ebene. Auf dieser Ebene gibt es viele Städte, und die Städte sind miteinander verbunden. Jetzt müssen wir den kürzesten Weg finden, um alle Städte zu besuchen. Wir haben zum Beispiel die Städte A, B, C, D, E. Da wir nun die Koordinaten zwischen Städten kennen, was gleichbedeutend mit der Kenntnis der Entfernung zwischen Städten ist, können wir nun eine Sequenz finden, die den kürzesten Weg zu allen Städten A, B, C, D und E bilden kann. Nach der Berechnung kann es beispielsweise B-->A-->C-->E-->D sein. Mit anderen Worten: Finden Sie diese Reihenfolge.
Aufzählung
Um dieses Problem zu lösen, gibt es tatsächlich viele Lösungen. Um es ganz klar auszudrücken: Wir müssen dann nur eine Reihenfolge finden, die die Summe der Pfade minimieren kann Das einfachste, was man sich vorstellen kann, ist die natürliche Aufzählung. Lassen Sie zum Beispiel zuerst A gehen und gehen Sie dann von der Annahme aus, dass der nächste Abstand zu A B ist, gehen Sie dann zu B und gehen Sie dann von B aus. Dies ist natürlich eine lokale gierige Strategie, und es ist einfach, das lokale Optimum zu erreichen. Dann können wir DP zu diesem Zeitpunkt berücksichtigen, das heißt, wir gehen immer noch davon aus, dass wir bei A beginnen, und stellen dann sicher, dass es zwei Städte gibt die kürzeste, 3 Städte sind die kürzeste und 4 und 5 sind die kürzesten. Nehmen Sie abschließend dasselbe von B an. Oder zählen Sie direkt alle Situationen auf und berechnen Sie die Entfernung. Aber egal, was passiert, mit zunehmender Anzahl von Städten wird auch ihre Komplexität zunehmen. Daher müssen wir jetzt Wege finden, wie wir die Computertechnik auf unser menschliches Fachwissen zurückführen können. Ich nenne es „Blindheit“.
Intelligenter Algorithmus
Lassen Sie uns nun über diesen intelligenten Algorithmus sprechen und warum er verwendet wird. Wir haben gerade gesagt, dass die vorherige Lösung für große Datenmengen sehr rechenintensiv sein wird. , es ist möglicherweise nicht einfach zu schreiben. Zu diesem Zeitpunkt wollen wir also zunächst einmal allein für das TSP-Problem eine Sequenz, eine Sequenz, die sich nicht wiederholt. Gibt es derzeit eine einfachere Lösung? Und wenn die Datenmenge groß genug ist, brauchen wir nicht unbedingt eine völlig genaue und völlig minimale Lösung, solange sie nah dran ist. Wenn wir also derzeit herkömmliche Algorithmen verwenden, berechnen wir nur nach unseren Regeln, und wir wissen nicht wirklich, was die Standardantwort ist. Es ist auch schwierig, einen Schwellenwert festzulegen, für den die Berechnung gestoppt werden soll traditionelle Algorithmen. Aber für uns Menschen gibt es etwas, das man „Glück“ nennt. Manche Menschen haben so viel Glück, dass sie über die Antwort verwirrt sein können, sobald sie in ihre Seele eindringen. Unser intelligenter Algorithmus ähnelt also tatsächlich ein wenig „Monkey“. Aber die Leute achten auf Fähigkeiten. Die Erfahrung zeigt, dass drei lange und ein kurzes die kürzeste Antwort sind. Oder wenn Sie nach einem Freund suchen, der so gut aussieht wie ein Blogger. Sie benötigen nur ein Stück der 40er-Serie (30er ist auch in Ordnung) Die Grafikkarte kann problemlos entnommen werden. Meng erfordert Geschick, wir nennen das Strategie.
STRATEGIE
Also die Technik, über die wir gerade gesprochen haben, dieser Trick. Bei intelligenten Algorithmen ist diese Maske eine unserer Strategien. Wie können wir es loswerden, damit unsere Lösung vernünftiger wird? Dann werden zu diesem Zeitpunkt hundert Blumen blühen. Nehmen wir als Beispiel die beiden klassischsten Algorithmen, einen ist der genetische Algorithmus und der andere ist der Partikelschwarm-Algorithmus (PSO). Als Beispiel verwendeten sie eine Strategie zur Entschlüsselung, wie z. B. einen genetischen Algorithmus, indem sie zunächst eine Reihe von Lösungen und eine Reihe von Sequenzen generierten und diese Lösungen dann auf der Grundlage unserer natürlichen Selektionsstrategie überprüften Nutzen Sie diese Lösungen, um neue und bessere Lösungen zu finden. Nachdem ich so hin und her gegangen war, bekam ich endlich eine gute Lösung. Der Partikelschwarm ist ähnlich. Wir werden diese Teile im Detail erklären, wenn wir sie verwenden.
Algorithmus
Was ist nun der Algorithmus, da wir diese Strategie kennen? Tatsächlich sind es die Schritte zur Implementierung dieser Strategien, die unser Code, unsere Schleife usw. sind Datenstruktur. Wir müssen erkennen, was wir gerade erwähnt haben, wie z. B. natürliche Selektion, wie unser TSP, wie man zufällig eine Reihe von Lösungen generiert.
Datenbeispiel
Okay, wir haben hier einige grundlegende Konzepte besprochen. Schauen wir uns jetzt an, wie wir dieses TSP-Problem darstellen Ganz einfach. Nehmen wir an, dass es 14 Städte gibt:
data = np.array([16.47, 96.10, 16.47, 94.44, 20.09, 92.54,
22.39, 93.37, 25.23, 97.24, 22.00, 96.05, 20.47, 97.02,
17.20, 96.29, 16.30, 97.38, 14.05, 98.12, 16.53, 97.38,
21.52, 95.59, 19.41, 97.13, 20.09, 92.55]).reshape((14, 2))Mittlerweile sind 14 Städte darauf vertreten.
Dann fangen wir mit unserer Lösung an
Genetischer Algorithmus
ok, dann reden wir darüber, wie unser genetischer Algorithmus ist. Das ist das Gleiche Ich werde dies nutzen, um das TSP-Problem zu lösen.
Lassen Sie uns nun einen Blick darauf werfen, wie unser genetischer Algorithmus getäuscht wird.
算法流程
遗传算法其实是在用计算机模拟我们的物种进化。其实更加通俗的说法是筛选，这个就和我们袁老爷爷种植水稻一样。有些个体发育良好，有些个体发育不好，那么我就先筛选出发育好的，然后让他们去繁衍后代，然后再筛选，最后得到高产水稻。其实也和我们社会一样，不努力就木有女朋友就不能保留自己的基因，然后剩下的人就是那些优秀的人和富二代的基因，这就是现实呀。所以得好好学习，天天向上！
那么回到主题，我们的遗传算法就是在模拟这一个过程，模拟一个物竞天择的过程。
所以在我们的算法里面也是分为几大块
繁殖
首先我们的种群需要先繁殖。这样才能不断产生优良基于，那么对应我们的算法，假设我们需要求取
Y = np.sin(10 * x) * x + np.cos(2 * x) * x
的最大值（在一个范围内）那么我们的个体就是一组（X1）的解。好的个体就会被保留，不好的就会被pass，选择标准就是我们的函数 Y 。那么问题来了如何模拟这个过程？我们都知道在繁殖后代的时候我们是通过DNA来保留我们的基因信息，在这个过程当中，父母的DNA交互，并且在这个过程当中会产生变异，这样一来，父母双方的优秀基于会被保存，并且产生的变异有可能诞生更加优秀的后代。
所以接下来我们需要模拟我们的ＤＮＡ，进行交叉和变异。
交叉
这个交叉过程和我们的生物其实很像，当然我们在我们的计算机里面对于数字我们可以将其转化为二进制，当做我们的DNA
交叉的方式有很多，我们这边选择这一个，进行交叉。
变异
那这个在我们这里就更加简单了
我们只需要在交叉之后，再随机选择几个位置进行改变值就可以了。当然变异的概率是很小的，并且是随机的，这一点要注意。并且由于变异是随机的，所以不排除生成比原来还更加糟糕的个体。
选择
最后我们按照一定的规则去筛选这个些个体就可以了，然后淘汰原来的个体。那么在我们的计算机里面是使用了两个东西，首先我们要把原来二进制的玩意，给转化为我们原来的十进制然后带入我们的函数运算，然后保存起来，之后再每一轮统一筛选一下就好了。
逆转
这个咋说呢，说好听点叫逆转，难听点就算，对于一些新的生成的不好的解，我们是要舍弃的。
代码
那么这部分用代码描述的话就是这样的：
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
Population_Size = 100
Iteration_Number = 200
Cross_Rate = 0.8
Mutation_Rate = 0.003
Dna_Size = 10
X_Range=[0,5]
def F(x):
'''
目标函数，需要被优化的函数
:param x:
:return:
'''
return np.sin(10 * x) * x + np.cos(2 * x) * x
def CrossOver(Parent,PopSpace):
'''
交叉DNA，我们直接在种群里面选择一个交配
然后就生出孩子了
:param parent:
:param PopSpace:
:return:
'''
if(np.random.rand()) < Cross_Rate:
cross_place = np.random.randint(0, 2, size=Dna_Size).astype(np.bool)
cross_one = np.random.randint(0, Population_Size, size=1) #选择一位男/女士交配
Parent[cross_place] = PopSpace[cross_one,cross_place]
return Parent
def Mutate(Child):
'''
变异
:param Child:
:return:
'''
for point in range(Dna_Size):
if np.random.rand() < Mutation_Rate:
Child[point] = 1 if Child[point] == 0 else 0
return Child
def TranslateDNA(PopSpace):
'''
把二进制转化为十进制方便计算
:param PopSpace:
:return:
'''
return PopSpace.dot(2 ** np.arange(Dna_Size)[::-1]) / float(2 ** Dna_Size - 1) * X_Range[1]
def Fitness(pred):
'''
这个其实是对我们得到的F(x)进行换算，其实就是选择的时候
的概率，我们需要处理负数，因为概率不能为负数呀
pred 这是一个二维矩阵
:param pred:
:return:
'''
return pred + 1e-3 - np.min(pred)
def Select(PopSpace,Fitness):
'''
选择
:param PopSpace:
:param Fitness:
:return:
'''
'''
这里注意的是，我们先按照权重去选择我们的优良个体，所以我们这里选择的时候允许重复的元素出现
之后我们就可以去掉这些重复的元素，这样才能实现保留良种去除劣种。100--》70（假设有30个重复）
如果不允许重复的话，那你相当于没有筛选
'''
Better_Ones = np.random.choice(np.arange(Population_Size), size=Population_Size, replace=True,
p=Fitness / Fitness.sum())
# np.unique(Better_Ones) #这个是我后面加的
return PopSpace[Better_Ones]
if __name__ == '__main__':
PopSpace = np.random.randint(2, size=(Population_Size, Dna_Size)) # initialize the PopSpace DNA
plt.ion()
x = np.linspace(X_Range, 200)
# plt.plot(x, F(x))
plt.xticks([0,10])
plt.yticks([0,10])
for _ in range(Iteration_Number):
F_values = F(TranslateDNA(PopSpace))
# something about plotting
if 'sca' in globals():
sca.remove()
sca = plt.scatter(TranslateDNA(PopSpace), F_values, s=200, lw=0, c='red', alpha=0.5)
plt.pause(0.05)
# GA part (evolution)
fitness = Fitness(F_values)
print("Most fitted DNA: ", PopSpace[np.argmax(fitness)])
PopSpace = Select(PopSpace, fitness)
PopSpace_copy = PopSpace.copy()
for parent in PopSpace:
child = CrossOver(parent, PopSpace_copy)
child = Mutate(child)
parent[:] = child
plt.ioff()
plt.show()这个代码是以前写的，逆转没有写上（下面的有）
TSP遗传算法
ok,刚刚的例子是拿的解方程，也就是说是一个连续问题吧，当然那个连续处理的话并不是很好，只是一个演示。那么我们这个的话其实类似的。首先我们的ＤＮＡ，是城市的路径，也就是A-B-C-D等等，当然我们用下标表示城市。
种群表示
首先我们确定了使用城市的序号作为我们的个体DNA，例如咱们种群大小为100，有ＡＢＣＤ四个城市，那么他就是这样的，我们先随机生成种群，长这个样：
1 2 3 4
2 3 4 5
3 2 1 4
...
那个1,2,3,4是ABCD的序号。
交叉与变异
这里面的话，值得一提的就是，由于暂定城市需要是不能重复的，且必须是完整的，所以如果像刚刚那样进行交叉或者变异的话，那么实际上会出点问题，我们不允许出现重复，且必须完整，对于我们的DNA，也就是咱们瞎蒙的个体。
代码
由于咱们每一步在代码里面都有注释，所以的话咱们在这里就不再进行复述了。
from math import floor
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
class Gena_TSP(object):
"""
使用遗传算法解决TSP问题
"""
def __init__(self, data, maxgen=200,
size_pop=200, cross_prob=0.9,
pmuta_prob=0.01, select_prob=0.8
):
self.maxgen = maxgen # 最大迭代次数
self.size_pop = size_pop # 群体个数，（一次性瞎蒙多少个解）
self.cross_prob = cross_prob # 交叉概率
self.pmuta_prob = pmuta_prob # 变异概率
self.select_prob = select_prob # 选择概率
self.data = data # 城市的坐标数据
self.num = len(data) # 有多少个城市，对应多少个坐标，对应染色体的长度（我们的解叫做染色体）
"""
计算城市的距离，我们用矩阵表示城市间的距离
"""
self.__matrix_distance = self.__matrix_dis()
self.select_num = int(self.size_pop * self.select_prob)
# 通过选择概率确定子代的选择个数
"""
初始化子代和父代种群，两者相互交替
"""
self.parent = np.array([0] * self.size_pop * self.num).reshape(self.size_pop, self.num)
self.child = np.array([0] * self.select_num * self.num).reshape(self.select_num, self.num)
"""
负责计算每一个个体的（瞎蒙的解）最后需要多少距离
"""
self.fitness = np.zeros(self.size_pop)
self.best_fit = []
self.best_path = []
# 保存每一步的群体的最优路径和距离
def __matrix_dis(self):
"""
计算14个城市的距离，将这些距离用矩阵存起来
:return:
"""
res = np.zeros((self.num, self.num))
for i in range(self.num):
for j in range(i + 1, self.num):
res[i, j] = np.linalg.norm(self.data[i, :] - self.data[j, :])
res[j, i] = res[i, j]
return res
def rand_parent(self):
"""
初始化种群
:return:
"""
rand_ch = np.array(range(self.num))
for i in range(self.size_pop):
np.random.shuffle(rand_ch)
self.parent[i, :] = rand_ch
self.fitness[i] = self.comp_fit(rand_ch)
def comp_fit(self, one_path):
"""
计算，咱们这个路径的长度，例如A-B-C-D
:param one_path:
:return:
"""
res = 0
for i in range(self.num - 1):
res += self.__matrix_distance[one_path[i], one_path[i + 1]]
res += self.__matrix_distance[one_path[-1], one_path[0]]
return res
def out_path(self, one_path):
"""
输出我们的路径顺序
:param one_path:
:return:
"""
res = str(one_path[0] + 1) + '-->'
for i in range(1, self.num):
res += str(one_path[i] + 1) + '-->'
res += str(one_path[0] + 1) + '\n'
print(res)
def Select(self):
"""
通过我们的这个计算的距离来计算出概率，也就是当前这些个体DNA也就瞎蒙的解
之后我们在通过概率去选择个体，放到child里面
:return:
"""
fit = 1. / (self.fitness) # 适应度函数
cumsum_fit = np.cumsum(fit)
pick = cumsum_fit[-1] / self.select_num * (np.random.rand() + np.array(range(self.select_num)))
i, j = 0, 0
index = []
while i < self.size_pop and j < self.select_num:
if cumsum_fit[i] >= pick[j]:
index.append(i)
j += 1
else:
i += 1
self.child = self.parent[index, :]
def Cross(self):
"""
模仿DNA交叉嘛，就是交换两个瞎蒙的解的部分的解例如
A-B-C-D
C-D-A-B
我们选几个交叉例如这样
A-D-C-B
1,3号交换了位置，当然这里注意可不能重复啊
:return:
"""
if self.select_num % 2 == 0:
num = range(0, self.select_num, 2)
else:
num = range(0, self.select_num - 1, 2)
for i in num:
if self.cross_prob >= np.random.rand():
self.child[i, :], self.child[i + 1, :] = self.intercross(self.child[i, :],
self.child[i + 1, :])
def intercross(self, ind_a, ind_b):
"""
这个是我们两两交叉的具体实现
:param ind_a:
:param ind_b:
:return:
"""
r1 = np.random.randint(self.num)
r2 = np.random.randint(self.num)
while r2 == r1:
r2 = np.random.randint(self.num)
left, right = min(r1, r2), max(r1, r2)
ind_a1 = ind_a.copy()
ind_b1 = ind_b.copy()
for i in range(left, right + 1):
ind_a2 = ind_a.copy()
ind_b2 = ind_b.copy()
ind_a[i] = ind_b1[i]
ind_b[i] = ind_a1[i]
x = np.argwhere(ind_a == ind_a[i])
y = np.argwhere(ind_b == ind_b[i])
if len(x) == 2:
ind_a[x[x != i]] = ind_a2[i]
if len(y) == 2:
ind_b[y[y != i]] = ind_b2[i]
return ind_a, ind_b
def Mutation(self):
"""
之后是变异模块，这个就是按照某个概率，去替换瞎蒙的解里面的其中几个元素。
:return:
"""
for i in range(self.select_num):
if np.random.rand() <= self.cross_prob:
r1 = np.random.randint(self.num)
r2 = np.random.randint(self.num)
while r2 == r1:
r2 = np.random.randint(self.num)
self.child[i, [r1, r2]] = self.child[i, [r2, r1]]
def Reverse(self):
"""
近化逆转，就是说下一次瞎蒙的解如果没有更好的话就不进入下一代，同时也是随机选择一个部分的
我们不是一次性全部替换
:return:
"""
for i in range(self.select_num):
r1 = np.random.randint(self.num)
r2 = np.random.randint(self.num)
while r2 == r1:
r2 = np.random.randint(self.num)
left, right = min(r1, r2), max(r1, r2)
sel = self.child[i, :].copy()
sel[left:right + 1] = self.child[i, left:right + 1][::-1]
if self.comp_fit(sel) < self.comp_fit(self.child[i, :]):
self.child[i, :] = sel
def Born(self):
"""
替换，子代变成新的父代
:return:
"""
index = np.argsort(self.fitness)[::-1]
self.parent[index[:self.select_num], :] = self.child
def main(data):
Path_short = Gena_TSP(data) # 根据位置坐标，生成一个遗传算法类
Path_short.rand_parent() # 初始化父类
## 绘制初始化的路径图
fig, ax = plt.subplots()
x = data[:, 0]
y = data[:, 1]
ax.scatter(x, y, linewidths=0.1)
for i, txt in enumerate(range(1, len(data) + 1)):
ax.annotate(txt, (x[i], y[i]))
res0 = Path_short.parent[0]
x0 = x[res0]
y0 = y[res0]
for i in range(len(data) - 1):
plt.quiver(x0[i], y0[i], x0[i + 1] - x0[i], y0[i + 1] - y0[i], color='r', width=0.005, angles='xy', scale=1,
scale_units='xy')
plt.quiver(x0[-1], y0[-1], x0[0] - x0[-1], y0[0] - y0[-1], color='r', width=0.005, angles='xy', scale=1,
scale_units='xy')
plt.show()
print('初始染色体的路程: ' + str(Path_short.fitness[0]))
# 循环迭代遗传过程
for i in range(Path_short.maxgen):
Path_short.Select() # 选择子代
Path_short.Cross() # 交叉
Path_short.Mutation() # 变异
Path_short.Reverse() # 进化逆转
Path_short.Born() # 子代插入
# 重新计算新群体的距离值
for j in range(Path_short.size_pop):
Path_short.fitness[j] = Path_short.comp_fit(Path_short.parent[j, :])
index = Path_short.fitness.argmin()
if (i + 1) % 50 == 0:
print('第' + str(i + 1) + '步后的最短的路程: ' + str(Path_short.fitness[index]))
print('第' + str(i + 1) + '步后的最优路径:')
Path_short.out_path(Path_short.parent[index, :]) # 显示每一步的最优路径
# 存储每一步的最优路径及距离
Path_short.best_fit.append(Path_short.fitness[index])
Path_short.best_path.append(Path_short.parent[index, :])
return Path_short # 返回遗传算法结果类
if __name__ == '__main__':
data = np.array([16.47, 96.10, 16.47, 94.44, 20.09, 92.54,
22.39, 93.37, 25.23, 97.24, 22.00, 96.05, 20.47, 97.02,
17.20, 96.29, 16.30, 97.38, 14.05, 98.12, 16.53, 97.38,
21.52, 95.59, 19.41, 97.13, 20.09, 92.55]).reshape((14, 2))
main(data)运行结果
ok,我们来看看运行的结果：
Das obige ist der detaillierte Inhalt vonWie implementiert man mit Python einen genetischen Algorithmus zur Lösung des Traveling Salesman Problem (TSP)?. Für weitere Informationen folgen Sie bitte anderen verwandten Artikeln auf der PHP chinesischen Website!