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How Can I Fit Empirical Data to Theoretical Distributions Using Scipy in Python?

使用 Scipy 将经验分布拟合到理论分布

简介


您有一个整数值的大型数据集,旨在计算 p 值,即概率遇到更高的价值。为了确定这些概率,您需要寻找近似数据分布的理论分布。本文探讨了如何使用 Python 的 Scipy 包来实现此目的。


拟合分布


Scipy 的 scipy.stats 模块提供了连续和离散的广泛集合概率分布。每个分布都有自己的参数来表征其形状和行为。目标是根据拟合优度检验找到最适合您的经验数据的分布。


拟合优度检验


拟合优度检验测量经验分布与理论分布之间的差异。常见的检验包括柯尔莫哥洛夫-斯米尔诺夫检验和卡方检验。 Scipy 提供了执行这些测试的函数,允许您评估候选分布的适合度。

误差平方和 (SSE)


One方法是利用误差平方和 (SSE) 作为拟合优度度量。 SSE 计算经验概率密度函数和理论概率密度函数之间的平方差。具有最小 SSE 的分布被认为是最佳拟合。


Python 实现


以下 Python 代码演示了如何使数据符合理论分布使用 SSE:


<br>导入 pandas 作为 pd<br>导入numpy as np<br>import scipy.stats as st<br>import matplotlib.pyplot as plt<p>data = pd.read_csv('data.csv') # 替换为你的数据文件</p><h1 id="数据直方图">数据直方图</h1><p>plt.hist(data, bins=50)<br>plt.show()</p><h1 id="候选分布">候选分布</h1><p>dist_names = ['norm', 'expon', 'gamma', 'beta']</p><h1 id="拟合每个分布并计算SSE">拟合每个分布并计算SSE</h1><p>best_distribution = None<br>min_sse = np.inf<br>for dist in dist_names:</p><pre class="brush:php;toolbar:false">dist = getattr(st, dist)
params = dist.fit(data)

# Calculate SSE
sse = np.mean((dist.pdf(data, *params) - np.histogram(data, bins=50, density=True)[0]) ** 2)

# Update the best distribution if necessary
if sse <h1 id="打印最佳拟合的分布参数">打印最佳拟合的分布参数</h1><p>print(best_distribution[0].name, best_distribution[1])<br></p>

此代码提供最佳拟合分布的名称及其估计参数。您可以使用这些参数来计算 p 值并评估分布的拟合优度。

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