如何使用 NumPy 和 PyTables 在 Python 中处理极大的矩阵？

使用 NumPy 在 Python 中处理极大矩阵

NumPy 是一个强大的 Python 数值运算库，擅长处理大型矩阵。然而，当遇到特别大的矩阵时，例如尺寸超过 50000 x 50000 的矩阵，其功能可能会受到限制。这种限制源于此类矩阵的大量内存需求。

克服内存限制

处理大型矩阵的挑战在于它们需要大量的内存。为了解决这个问题，NumPy 未能提供原生解决方案。相反，请考虑将 PyTables 与 NumPy 结合使用。

PyTables 通过利用 HDF 格式将数据直接存储在磁盘上提供了一种实用的解决方法。此方法允许可选压缩，可能将内存占用量减少 10 倍或更多。 PyTables 还拥有令人印象深刻的性能，可以对包含数百万行的数据集进行快速操作。

以 NumPy 数组形式访问数据

从 PyTables 检索数据以在 NumPy 中进行处理非常简单。指定所需的行并将它们分配给 NumPy 记录：

<code class="python">data = table[row_from:row_to]</code>

HDF 库透明地处理数据提取和转换为 NumPy 格式，确保两个库之间的无缝集成。

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