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ovito有linux系統下的安裝套件。 OVITO是一個針對原子和粒子模擬資料的科學視覺化和分析軟體,該程式在開源許可下可在所有主要平台免費使用,即支援Windows、Linux、macOS等主要平台。 linux下安裝ovito的方法:1.在官網下載linux版本的壓縮包;2、使用tar指令解壓縮;3、使用export指令設定環境變數即可。

ovito有linux系統下的安裝包嗎

本教學操作環境:linux7.3系統、Dell G3電腦。

OVITO是一個針對原子和粒子模擬資料的科學視覺化和分析軟體。它幫助科學家更了解材料現象和物理過程。該程式在開源許可下可在所有主要平台(Windows、Linux、macOS等)免費使用。作為分析、理解和說明模擬結果的有力工具,它已在越來越多的計算模擬研究中發揮作用。

ovito有linux系統下的安裝套件。 官網下載https://www.ovito.org/

ovito有linux系統下的安裝包嗎

ovito有linux系統下的安裝包嗎

#linux下安裝ovito

1、在官網下載linux版本的壓縮套件

2、解壓縮即可

tar zxvf ovito-2.9.0-x86_64.tar.gz
cd ovito-2.9.0-x86_64

3、設定環境變數

export OVITO_HOME=/path/to/ovito-2.9.0-x86_64
export PATH=$OVITO_HOME/bin:$PATH

請把/path/to/ovito-2.9.0-x86_64 改為解壓縮後的實際路徑。

在命令列輸入

which ovito

如果回饋了 ovito 所在路徑即設定完成,我們嘗試執行它。

ovito

如果程式啟動失敗並顯示錯誤訊息 ovito:/usr/lib64/libstdc .so.6 : 版本CXXABI_1.3.8 未找到 ,請下載此版本的 libstdc  。所以並複製兩個 .so 檔案 OVITO安裝的 lib/ovito/ 子目錄。它們是必需的,因為系統上現有的 libstdc  版本與OVITO二進位檔案不相容。

然後拷貝到對應目錄

export OVITO_HOME=/path/to/ovito-2.9.0-x86_64
cp libstdc++.so.6 $OVITO_HOME/lib/ovito
cp libstdc++.so.6.0.21 $OVITO_HOME/lib/ovito

我們再次執行命令

ovito

如果成功開啟介面,表示成功運行。

如果是linux環境對圖形介面支援的不好,我們可以用 ovitos 命令進行命令列方式進行影像處理。

報錯:缺少nivida的函式庫

##在計算節點執行 ovitos 指令時,提示缺少libnvidia-tls.so和libnvidia-glcore.so函式庫。

這個庫存在於nvidia的驅動程式庫中,我們從官網下載:傳送門 (opens new window)。依序選擇:Linux - x86_64 - RHEL - 6 - rpm(local) ,下載 cuda-repo-rhel6-7-5-local-7.5-18.x86_64.rpm 壓縮套件。

然後解壓縮rpm包並找到這兩個庫

rpm2cpio cuda-repo-rhel6-7-5-local-7.5-18.x86_64.rpm | cpio -div
cd var/cuda-repo-7-5-local
rpm2cpio xorg-x11-drv-nvidia-libs-352.39-1.el6.x86_64.rpm  | cpio -div
rpm2cpio xorg-x11-drv-nvidia-gl-352.39-1.el6.x86_64.rpm  | cpio -div
cd usr/lib64/nvidia

我們就可以找到它們了,然後將這兩個庫拷貝到合適的位置,並添加到LD_LIBRARY_PATH環境變量中:

export  LD_LIBRARY_PATH=/path/to/nvidia-lib:$LD_LIBRARY_PATH

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