rosetta是一套用於模擬大分子結構的綜合軟體;該軟體最早與1998年用FORTRAN編寫,用於對小蛋白進行abinitio預測,現在已經使用“C ”重寫,作為一種靈活、多用途的應用,它包括蛋白質和核酸的結構預測、設計和重塑工具。
本教學操作環境:windows10系統、DELL G3電腦。
rosetta是一套用於模擬大分子結構的綜合軟體。最早與1998年用FORTRAN編寫,用於對小蛋白進行abinitio預測。現在已經用C 重寫,作為一種靈活、多用途的應用,它包括蛋白質和核酸的結構預測、設計和重塑工具。 Rosetta的web伺服器已經運行了數十億的結構預測和蛋白質設計模擬。
Rosetta的web伺服器已經運行了數十億的結構預測和蛋白質設計模擬,還有數十億甚至數萬億運行在超級電腦叢集上。
研究人員利用Rosetta來更了解傳染病、癌症和自體免疫疾病的治療方法。進一步的應用包括開發疫苗、新材料、靶向蛋白質黏合劑和酵素設計。
Rosetta最初是一個結構預測工具,在 CASP 社群範圍內的盲預測訓練中一直表現出色。它已經成長為提供多種有效的取樣演算法來探索主鏈、側鍊和序列空間,其優點已推廣到包括 RNA-puzzles 和 CAPRI 在內的更多社群範圍的練習中。羅塞塔擁有廣泛測試的能量評分功能,包含從折疊到對接到設計的無與倫比的應用範圍。
Rosetta 可以免費提供給學術和政府實驗室,已經有超過10000個免費許可證在使用。還包括一個活躍的論壇。若要下載Rosetta,請申請許可證。
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