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K-means演算法在Python中的實現

小云云
小云云原創
2017-12-06 10:28:101907瀏覽

K-means是機器學習中一個比較常用的演算法,屬於無監督學習演算法,其常被用於資料的聚類,只需為它指定簇的數量即可自動將資料聚合到多類中,相同簇中的數據相似度較高,不同簇中數據相似度較低。

K-MEANS演算法是輸入聚類個數k,以及包含 n個資料物件的資料庫,輸出滿足方差最小標準k個聚類的一種演算法。 k-means 演算法接受輸入量k ;然後將n個資料物件劃分為k個聚類以便使得所獲得的聚類滿足:同一聚類中的對象相似度較高;而不同聚類中的對象相似度較小。本文將和大家介紹K-means演算法在Python中的實作。

核心思想

透過迭代尋找k個類別簇的一種分割方案,使得用這k個類別簇的平均值來代表對應各類別樣本時所得的總體誤差最小。

k個聚類具有以下特點:各聚類本身盡可能的緊湊,而各聚類之間盡可能的分開。

k-means演算法的基礎是最小誤差平方和準則,K-menas的優缺點:

##優點:

原理簡單

速度快
對大資料集有比較好的伸縮性

#缺點:

需要指定聚類數量K

對異常值敏感
對初始值敏感

K-means的聚類過程
##其聚類過程類似於梯度下降演算法,建立代價函數並透過迭代使得代價函數值越來越小

適當選擇c個類別的初始中心;

在第k次迭代中,對任意一個樣本,求其到c個中心的距離,將該樣本歸到距離最短的中心所在的類別;

利用均值等方法更新該類別的中心值;
對於所有的c個聚類中心,如果利用(2)(3)的迭代法更新後,值保持不變,則迭代結束,否則繼續迭代。

該演算法的最大優勢在於簡潔快速。演算法的關鍵在於初始中心的選擇和距離公式。

K-means 實例展示


python中km的一些參數:

sklearn.cluster.KMeans(
  n_clusters=8,
  init='k-means++', 
  n_init=10, 
  max_iter=300, 
  tol=0.0001, 
  precompute_distances='auto', 
  verbose=0, 
  random_state=None, 
  copy_x=True, 
  n_jobs=1, 
  algorithm='auto'
  )
n_clusters: 簇的个数,即你想聚成几类
init: 初始簇中心的获取方法
n_init: 获取初始簇中心的更迭次数,为了弥补初始质心的影响,算法默认会初始10个质心,实现算法,然后返回最好的结果。
max_iter: 最大迭代次数(因为kmeans算法的实现需要迭代)
tol: 容忍度,即kmeans运行准则收敛的条件
precompute_distances:是否需要提前计算距离,这个参数会在空间和时间之间做权衡,如果是True 会把整个距离矩阵都放到内存中,auto 会默认在数据样本大于featurs*samples 的数量大于12e6 的时候False,False 时核心实现的方法是利用Cpython 来实现的
verbose: 冗长模式(不太懂是啥意思,反正一般不去改默认值)
random_state: 随机生成簇中心的状态条件。
copy_x: 对是否修改数据的一个标记,如果True,即复制了就不会修改数据。bool 在scikit-learn 很多接口中都会有这个参数的,就是是否对输入数据继续copy 操作,以便不修改用户的输入数据。这个要理解Python 的内存机制才会比较清楚。
n_jobs: 并行设置
algorithm: kmeans的实现算法,有:'auto', ‘full', ‘elkan', 其中 ‘full'表示用EM方式实现
虽然有很多参数,但是都已经给出了默认值。所以我们一般不需要去传入这些参数,参数的。可以根据实际需要来调用。


#下面展示一個程式碼範例

from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn.externals import joblib
from sklearn import cluster
import numpy as np

# 生成10*3的矩阵
data = np.random.rand(10,3)
print data
# 聚类为4类
estimator=KMeans(n_clusters=4)
# fit_predict表示拟合+预测,也可以分开写
res=estimator.fit_predict(data)
# 预测类别标签结果
lable_pred=estimator.labels_
# 各个类别的聚类中心值
centroids=estimator.cluster_centers_
# 聚类中心均值向量的总和
inertia=estimator.inertia_

print lable_pred
print centroids
print inertia

代码执行结果
[0 2 1 0 2 2 0 3 2 0]

[[ 0.3028348  0.25183096 0.62493622]
 [ 0.88481287 0.70891813 0.79463764]
 [ 0.66821961 0.54817207 0.30197415]
 [ 0.11629904 0.85684903 0.7088385 ]]
 
0.570794546829


#為了更直覺的描述,這次在圖上做一個展示,由於圖像上繪製二維比較直觀,所以資料調整到了二維,選取100個點繪製,聚類類別為3類

##
from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn.externals import joblib
from sklearn import cluster
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

data = np.random.rand(100,2)
estimator=KMeans(n_clusters=3)
res=estimator.fit_predict(data)
lable_pred=estimator.labels_
centroids=estimator.cluster_centers_
inertia=estimator.inertia_
#print res
print lable_pred
print centroids
print inertia

for i in range(len(data)):
  if int(lable_pred[i])==0:
    plt.scatter(data[i][0],data[i][1],color='red')
  if int(lable_pred[i])==1:
    plt.scatter(data[i][0],data[i][1],color='black')
  if int(lable_pred[i])==2:
    plt.scatter(data[i][0],data[i][1],color='blue')
plt.show()



#可以看到聚類效果還是不錯的,對k-means的聚類效率進行了一個測試,將維度擴寬到50維


資料規模消耗時間資料維度10000條4s50維度#100000條30s50維1000000條4'13s50維#為百萬級的數據,擬合時間還是能夠接受的,可見效率還是不錯,對模型的保存與其它的機器學習演算法模型保存類似

from sklearn.externals import joblib
joblib.dump(km,"model/km_model.m")

以上內容就是K -means演算法在Python中的實現,希望能幫助大家。

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