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协调专业AI代理,设计新药候选分子,涵盖合成路线、库存检查、ADMET/毒性评估、药理学评分及专利...

机械技能, 组织一组专门的AI剂用于药物设计.

功能概述

机械技能, 组织一组专门的AI剂用于药物设计.是一项面向实际任务的技能,主要用于Overview. 目的: 为特定目标/指标设计新药候选人(例如, "D")。它将相关步骤、工具调用和结果整理方式集中到统一流程中,帮助使用者更快完成目标并减少重复操作。

核心要点

  • 使用时应结合输入条件选择合适的执行方式,核对必要参数、依赖环境与输出内容,并按原始要求处理异常情况。
  • 该技能适合需要稳定复用相关能力的场景,可作为自动化工作流的一部分,也便于后续检查、调整和扩展。
  • 从功能定位来看,该技能强调把分散的操作要求整理成清晰、可复用的处理流程,使用户能够围绕既定目标快速准备输入、选择执行方式并获得结构化结果。

使用与执行

实际使用前应先确认任务范围、数据来源、运行环境、必要权限和关键参数,再依据技能说明逐步执行;若输入条件不完整,应先补齐信息或采用保守配置,避免因错误假设导致结果偏离需求。

结果检查与注意事项

执行过程中需要关注工具调用是否成功、接口或依赖是否可用、输出格式是否符合预期,并对异常提示、缺失字段和边界情况进行处理;涉及批量任务时,还应保存进度,避免中断后重复操作。

drug-team

一种元技能(meta-skill),用于协调一组专用于药物设计的 AI 智能体(agent)协同工作。

概述

  • 用途:针对给定靶点或适应症,在指定约束条件下(例如:“设计一种用于缓解疼痛的药物,logP < 3”)生成新型候选药物分子。
  • 智能体(Agents):
    1. Chem Synth(调用 chemistry-query 技能):提出分子骨架及合成路线。
    2. Synth Notebook(调用 synth-notebook 技能):可视化合成路线,优化产率,并进行安全性评估。
    3. Lab Inventory(调用 lab-inventory 技能):核查试剂库存情况,并估算合成成本。
    4. ADMET:基于 RDKit/ML 代理模型预测 QED、SA、logP、TPSA、pKa 等性质。
    5. Tox:检测 PAINS、Brenk 结构警示基团及 Ames 致突变性风险。
    6. Pharm:评估候选分子与靶点的结合亲和力(通过网络工具或对接代理实现)。
    7. Patent Scout(调用 patent_scout.py):扫描现有技术专利,计算新颖性得分,并通过网络检索识别潜在的阻碍性专利(blocking patents)。
  • 协同机制:各智能体之间通过迭代式轮询与消息传递持续优化候选分子。
  • 输出结果:包含 Top 3 候选分子的表格(含 SMILES 表达式、合成路线、各项评分)以及可视化内容(如分子结构图)。

触发词

  • drug design
  • design drug
  • painkiller
  • drug synthesis
  • synth pharm
  • design molecule
  • "low tox" drug
  • inventory-aware design
  • design with stock check
  • check stock for synthesis
  • patent
  • novelty
  • prior art

使用方式

被触发后,执行命令:scripts/orchestrate.py "{user_query}"。

集成说明

  • 调用 chemistry-query 技能获取初始分子骨架与合成路线。
  • 调用 synth-notebook 技能实现合成路线可视化、产率优化及安全性检查。
  • 集成 lab-inventory 技能以核查试剂库存并估算成本。
  • 综合考量产率、安全性(包括对路线中化学品的 SDS 扫描、风险评分与告警)及库存可用性,对候选分子进行可行性评分与排序。
  • 在完成药物设计后执行专利调研,将新颖性得分与阻碍性专利状态纳入最终候选分子的综合排名(例如:“高新颖性:无阻碍性专利”)。

依赖项

  • RDKit(已安装)
  • chemistry-query 技能(已存在)
  • synth-notebook 技能
  • lab-inventory 技能
  • Matplotlib / Plotly(用于可视化)
  • OpenClaw 子智能体启动能力
  • beautifulsoup4(用于 patent_scout 的网页抓取)

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