学术论文查找器

搜索 PubMed 并将论文导入 Zotero，或生成适用于 EndNote 的 RIS 文件。

配置要求

需设置以下环境变量：

• ZOTERO_API_KEY — Zotero API 密钥（获取地址：https://www.zotero.org/settings/keys/new）
• ZOTERO_USER_ID — 您的 Zotero 用户 ID

快速开始

1. 通过 DOI 查找论文

python3 scripts/pubmed_search.py --doi "10.1016/j.cell.2014.07.013"

2. 通过标题查找论文

python3 scripts/pubmed_search.py --title "circulating tumor cell clusters"

3. 通过作者查找论文

python3 scripts/pubmed_search.py --author "Aceto N" --year 2014

4. 添加至 Zotero

# 通过 PMID
python3 scripts/zotero_add.py --pmid 25171411

# 通过 DOI
python3 scripts/zotero_add.py --doi "10.1016/j.cell.2014.07.013"

5. 批量导入（多个 PMID）

python3 scripts/batch_import.py --pmids "25171411,30728496,41212905"

6. 生成 EndNote 可用的 RIS 文件

python3 scripts/generate_ris.py --pmids "25171411,30728496" --output literature.ris

脚本说明

• pubmed_search.py — 支持通过 DOI、标题或作者在 PubMed 中检索论文
• zotero_add.py — 支持通过 PMID 或 DOI 将论文添加至 Zotero
• batch_import.py — 批量添加多篇论文
• generate_ris.py — 生成适用于 EndNote 的 RIS 文件

使用示例

从参考文献中提取 PMID

当用户提供如下格式的参考文献时：

Aceto, N.; Bardia, A.; Miyamoto, D. T.; Donaldson, M. C.; Wittner, B. S.; Spencer, J. A.; Yu, M.; Pely, A.; Ting, K.; Haber, D. A.; Maheswaran, S. Circulating Tumor Cell Clusters Are Oligoclonal Precursors of Breast Cancer Metastasis. Cell 2014, 158 (5), 1110–1122. https://doi.org/10.1016/j.cell.2014.07.013.

1. 提取 DOI：10.1016/j.cell.2014.07.013
2. 执行搜索：python3 scripts/pubmed_search.py --doi "10.1016/j.cell.2014.07.013"
3. 返回结果：PMID 25171411
4. 添加至 Zotero：python3 scripts/zotero_add.py --pmid 25171411

为 EndNote 批量导入文献

用户拥有多个论文，希望统一导入 EndNote：

# 列出全部 PMID
python3 scripts/generate_ris.py --pmids "25171411,30728496,41212905,41651843,19945376" --output my_papers.ris

随后在 EndNote 中导入该 RIS 文件：文件 → 导入 → 选择 .ris 文件。