Apakah pangkalan data GTEx?

GTEx ialah pangkalan data komprehensif yang mengandungi data ekspresi gen daripada sampel tisu manusia. Kandungannya termasuk jujukan RNA, data eQTL dan maklumat lain yang berkaitan daripada 53 jenis tisu. Kegunaan termasuk memahami ekspresi gen khusus tisu, mengenal pasti gen berkaitan penyakit, mengkaji peraturan gen dan membangunkan ubat yang diperibadikan.

Apakah pangkalan data GTEx? Pangkalan data

GTEx (Gene Expression Histology) ialah sumber komprehensif yang mengandungi data ekspresi gen dan maklumat berkaitan untuk sampel tisu manusia.

Kandungan pangkalan data:

Pangkalan data GTex mengumpul sampel daripada lebih 700 penderma, meliputi 53 jenis tisu, termasuk semua organ dan tisu utama. Sampel telah disusun ke dalam lebih 15,000 jujukan RNA (RNA-Seq) dan set data microarray.

Jenis data:

• Ekspresi gen: Merakam tahap ekspresi gen dalam setiap tisu.
• Data eQTL: Mengenal pasti varian genetik tertentu yang mempengaruhi ekspresi gen.
• Data lain yang berkaitan: Termasuk maklumat histologi, fenotip klinikal dan maklumat transkriptomi.

Tujuan:

Pangkalan data GTEx menyediakan sumber yang berharga untuk penyelidikan bioperubatan. Ia boleh digunakan untuk:

• Memahami ekspresi gen khusus tisu: Menentukan corak ekspresi gen yang berbeza dalam jenis tisu yang berbeza.
• Kenal pasti gen berkaitan penyakit: Kenal pasti gen berkaitan penyakit dengan membandingkan ekspresi gen dalam pesakit penyakit dan individu yang sihat.
• Kaji peraturan gen: Gunakan data eQTL untuk mengkaji faktor genetik yang mempengaruhi ekspresi gen.
• Membangunkan perubatan yang diperibadikan: Membangunkan rawatan yang menyasarkan tisu tertentu dengan menganalisis ekspresi gen khusus tisu.

Akses data:

Data daripada pangkalan data GTEx boleh diperolehi secara percuma dari laman web rasminya. Pengguna boleh menapis set data mengikut jenis tisu, gen atau metadata lain.

Atas ialah kandungan terperinci Apakah pangkalan data GTEx?. Untuk maklumat lanjut, sila ikut artikel berkaitan lain di laman web China PHP!