Kejayaan dalam penemuan ubat RNA, model asas RNA pertama mendedahkan teknologi pengukuran pada tahap lebih daripada 1 bilion nukleotida

Editor |. KX

Baru-baru ini, syarikat bioteknologi Atomic AI mengumumkan kejayaan pembangunan model bahasa berskala besar (LLM) pertama yang menggunakan data pemetaan kimia. Atomic AI menggabungkan teknik pembelajaran mesin termaju dengan biologi struktur terkini untuk menyelesaikan misteri penemuan ubat RNA

Penyelidik di Atomic AI telah mencipta komponen platform baharu yang memanfaatkan koleksi analisis makmal basah tersuai dalaman bagi data pemetaan kimia berskala besar. Para saintis mengumpul data mengenai berjuta-juta jujukan RNA dan membuat lebih daripada satu bilion pengukuran tahap nukleotida. Dilatih mengenai data ini, ATOM-1 membangunkan pemahaman yang kaya tentang RNA, yang kemudiannya boleh digunakan untuk mengoptimumkan sifat corak RNA yang berbeza.

Alamat twitter Atomic AI: https://twitter.com/AtomicAICo/status/1735659469609037974

Atomic AI menerbitkan artikel pada 14 Disember bertajuk "ATOM-1: Model RNA yang dibina berdasarkan data kimia " Struktur dan Fungsi" ialah kertas pracetak yang diterbitkan pada bioRxiv. Dalam makalah ini, Atomic AI menerangkan secara terperinci komponen platform ATOM-1™ mereka yang unik Model asas ini boleh meramalkan struktur dan fungsi RNA dengan tepat dan memainkan peranan penting dalam meningkatkan pembangunan terapi RNA

. Pautan kertas: https://doi.org/10.1101/2023.12.13.571579

Dr. Manjunath Ramarao, ketua pegawai saintifik Atomic AI, berkata:

"ATOM-1 mampu meramalkan aspek struktur dan berfungsi RNA serta corak RNA ciri-ciri utama, termasuk molekul kecil, vaksin mRNA, siRNA dan RNA bulat, untuk membantu dalam reka bentuk terapeutik yang cekap rakan kongsi untuk membantu. Sahkan sasaran dan alatan RNA mereka untuk akhirnya menyampaikan rawatan yang mereka perlukan kepada pesakit dengan cepat dan lebih berkesan," kata Dr. Stephan Eismann, Saintis Pengasas dan Pengarah Pembelajaran Mesin di Atomic AI. Membina set data nukleotida RNA yang besar pengubahsuaian dan penjujukan generasi akan datang, pasukan Atomic AI mencipta model berasaskan RNA yang pertama Kami teruja dengan penggunaan luas model kami kepada aspek penyelidikan RNA yang lain dan penggunaannya dalam mengoptimumkan ubat berasaskan RNA data RNA berkualiti tinggi yang tersedia, seperti kestabilan dan kecekapan terjemahan vaksin mRNA atau aktiviti dan ketoksikan ubat berasaskan RNA dan ubat sasaran RNA menjadi semakin popular. Mengoptimumkan terapeutik ini memerlukan pemeriksaan eksperimen yang memakan masa dan mahal, manakala reka bentuk rasional memerlukan pemahaman yang tepat tentang struktur dan fungsi RNA Sehingga kini, terdapat sedikit data RNA berkualiti tinggi yang tersedia untuk komuniti sains hayat. Kerana kaedah sedia ada, seperti model haiwan untuk mengumpul maklumat in vivo atau mikroskopi cryo-elektron (cryo-EM) untuk menentukan struktur RNA 3D, adalah sukar untuk digunakan dan memakan masa. Mengoptimumkan sifat terapeutik RNA utama, termasuk kestabilan, ketoksikan dan kecekapan terjemahan, telah mencabar kerana kekurangan data "sebenar"

Model berasaskan RNA pertama yang dilatih pada data peta kimia

Untuk menangani cabaran reka bentuk ini, Atomic AI melancarkan ATOM-1, model berasaskan RNA pertama yang dilatih pada data peta kimia, melalui strategi pengumpulan data yang dibangunkan khusus untuk latihan pembelajaran mesin. Menggunakan rangkaian neural probe kecil di atas benam ATOM-1, kami menunjukkan bahawa model ini telah membangunkan perwakilan dalaman RNA yang kaya. Dilatih dengan jumlah data tambahan yang terhad, rangkaian kecil ini mencapai ketepatan terkini pada tugas ramalan RNA utama, menunjukkan bahawa pendekatan ini boleh membolehkan reka bentuk terapeutik merentas seluruh medan RNA.

Ilustrasi: Probe ATOM-1 untuk ramalan struktur sekunder dengan ringkasan ketepatan tinggi. (Sumber: kertas)

ATOM-1 boleh meramalkan struktur sekunder dan tertiari RNA dengan lebih tepat daripada kaedah yang diterbitkan sebelum ini

Ilustrasi: terlatih pada struktur sekunder dengan 257 probe linear Parametrik boleh digeneralisasikan kepada RNA lain. (Sumber: Kertas)

Ilustrasi: Kuar ATOM-1 untuk ramalan struktur tertiari menunjukkan ketepatan terkini. (Sumber: Kertas)

Terutama, dalam analisis retrospektif yang membandingkan ATOM-1 dengan alat pengiraan lain untuk reka bentuk vaksin, ATOM-1 mengatasi kesemua 1,600 kaedah lain untuk meramalkan kestabilan mRNA dalam larutan. Berdasarkan keputusan ini, model asas baharu boleh disesuaikan dengan data terhad untuk meramalkan sifat RNA yang berbeza, bukan sahaja menentukan struktur RNA tetapi juga meramalkan ciri utama terapeutik RNA yang lain.

Ilustrasi: Ramalan struktur probe ATOM-1 berbanding garis dasar tanpa benam model asas. (Sumber: Kertas)

Selama dua setengah tahun yang lalu, kami sengaja mereka bentuk dan mengumpul data untuk melatih model asas kami, kata Dr. Raphael Townshend, pengasas dan Ketua Pegawai Eksekutif "Atomic AI". "Melalui pembelajaran mesin dan kecerdasan buatan generatif, kami kini mempunyai peluang unik yang ATOM-1 boleh ditala dengan sebilangan kecil titik data awal untuk meramalkan struktur dan fungsi RNA dengan ketepatan yang tinggi

Zeng muncul di muka depan Science, Enjin struktur 3D RNA 3D dipacu AI milik Atomic AI

Atomic AI ialah syarikat bioteknologi baru muncul yang ditubuhkan pada Mei 2021 dan beribu pejabat di San Francisco Bay Area. Syarikat itu memberi tumpuan kepada memanfaatkan gabungan pembelajaran mesin dan biologi struktur untuk memajukan penemuan ubat RNA. Mereka telah membangunkan platform proprietari yang menggunakan model asas pembelajaran mendalam untuk meneroka dan mereka bentuk molekul kecil yang menyasarkan RNA, ubat berasaskan RNA dan alatan RNA

Artikel berkaitan teknologi Atomic AI "Pembelajaran Dalam Geometri bagi Struktur RNA" ("Pembelajaran Mendalam Geometrik of RNA Structure" "pembelajaran mendalam tentang struktur RNA") telah muncul di muka depan majalah Science.

Pautan artikel muka depan sains: https://www.science.org/doi/10.1126/science.abe5650

Enjin PARSE Atomic AI ialah enjin struktur 3D RNA dipacu kecerdasan buatan yang boleh menjana set data struktur RNA . Dengan menggabungkan model asas daripada pembelajaran mesin dengan eksperimen dalaman berskala besar di makmal basah, enjin mampu mendedahkan pengikat berfungsi sasaran RNA

Teknologi terobosannya meramalkan ligan berstruktur dan boleh diikat dengan kelajuan dan ketepatan motif RNA yang tidak pernah berlaku sebelum ini, yang merupakan halangan utama dalam kaedah penemuan ubat RNA semasa.

Dengan menggabungkan algoritma lanjutan dan penyelidikan biologi eksperimen berskala besar, ubat-ubatan yang disasarkan RNA dan berasaskan RNA novel boleh direka bentuk untuk merawat penyakit yang pada masa ini tiada ubat yang dipasarkan

Dengan memanfaatkan RNA 3D kami menemui dan mereka bentuk pangkalan data Struktur , Atomic AI merancang untuk memajukan pembangunan siri calon ubat molekul kecil yang direka secara rasional

Atomic AI telah mengumpulkan sejumlah AS$42 juta dalam dua pusingan pelaburan, yang terbaru adalah pembiayaan Siri A pada Januari 2023. Atomic AI telah mengumpul sejumlah $42 juta dalam pembiayaan dalam dua pusingan pelaburan, yang terbaru adalah pembiayaan Siri A pada Januari 2023

Atomic AI menerajui bidang biologi struktur yang dipertingkatkan kecerdasan buatan, dikuasakan oleh mesin Disokong oleh antara disiplin pasukan penyelidik pembelajaran, ahli kimia perubatan, jurutera dan ahli biologi eksperimen, serta penasihat saintifik strategik dan pelabur bertaraf dunia. Dengan menukar reka bentuk ubat RNA, mereka berjaya merawat penyakit yang tidak boleh dirawat

Tapak web rasmi AI Atomik: https://atomic.ai/

Kandungan rujukan: https://www.businesswire.com/news/home/20231215527488/ en /

Atas ialah kandungan terperinci Kejayaan dalam penemuan ubat RNA, model asas RNA pertama mendedahkan teknologi pengukuran pada tahap lebih daripada 1 bilion nukleotida. Untuk maklumat lanjut, sila ikut artikel berkaitan lain di laman web China PHP!