rosetta는 거대분자 구조를 시뮬레이션하기 위한 포괄적인 소프트웨어 세트입니다. 이 소프트웨어는 작은 단백질의 abinitio 예측을 위해 1998년 FORTRAN으로 처음 작성되었으며 이제 유연한 다목적 응용 프로그램으로 "C++"로 다시 작성되었습니다. 단백질과 핵산의 구조 예측, 설계 및 재구성.
이 튜토리얼의 운영 환경: Windows 10 시스템, DELL G3 컴퓨터.
로제타는 거대분자 구조를 시뮬레이션하기 위한 종합 소프트웨어입니다. 이는 1998년 FORTRAN에 처음 작성되었으며 작은 단백질의 비니티오 예측에 사용되었습니다. 이제 유연하고 다양한 응용 프로그램으로 C++로 다시 작성되었으며 단백질과 핵산의 구조 예측, 설계 및 재형성을 위한 도구가 포함되어 있습니다. Rosetta의 웹 서버는 구조 예측 및 단백질 설계를 위해 수십억 개의 시뮬레이션을 실행했습니다.
Rosetta의 웹 서버는 수십억 건의 구조 예측과 단백질 설계 시뮬레이션을 실행했으며, 슈퍼컴퓨터 클러스터에서 수십억 또는 심지어 수조 건 이상을 실행했습니다.
연구원들은 Rosetta를 사용하여 전염병, 암 및 자가면역 질환 치료법을 더 잘 이해합니다. 추가 응용 분야에는 백신, 신물질, 표적 단백질 결합제 및 효소 설계 개발이 포함됩니다.
Rosetta는 원래 구조 예측 도구였으며 CASP 커뮤니티 전체 블라인드 예측 훈련에서 지속적으로 좋은 성능을 발휘했습니다. 백본, 사이드 체인 및 시퀀스 공간을 탐색하기 위한 다양하고 효율적인 샘플링 알고리즘을 제공하도록 성장했으며 그 장점은 RNA 퍼즐 및 CAPRI를 포함한 보다 커뮤니티 전반의 연습으로 일반화되었습니다. Rosetta는 에너지 채점 기능을 광범위하게 테스트했으며 접는 것부터 도킹, 디자인까지 비교할 수 없는 범위의 응용 프로그램을 포괄합니다.
Rosetta는 학술 및 정부 연구실에서 무료로 사용할 수 있으며 10,000개 이상의 무료 라이센스가 사용되고 있습니다. 또한 활성 포럼이 포함되어 있습니다. Rosetta를 다운로드하려면 라이센스를 신청하세요.
Rosetta를 시험해 볼 준비가 되었다면 여기에서 이 튜토리얼을 시도해 보는 것이 좋습니다.
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