Thinkphp 的一个奇怪的500异常有关问题

Thinkphp 的一个奇怪的500错误问题
由于一个项目是thinkphp2.0的环境做的。

现在要使用git 提交版本的方式来开发。

于是就遇到一个奇怪的问题，我将文件放在一个git初始化的目录，使用git提交到服务器，然后再使用钩子将其同步到WWW的目录下面，进行实时查看。使用git提交过去的，查看首页就是空白页面，而且echo，phpinfo什么的都正常。

我直接将文件上传到www目录上去之后，也是能正常加载访问，没有任何问题。

唯独只有使用git的钩子提交过去的就是 500 Internal Server Error.

很奇怪，查看了nginx 的错误日志也没有。

怎么下手呢？
------解决方案--------------------
Runtime 目录中的内容会在程序运行时被改写
如果将其置于版本控制下，显然是要出问题的