GTEx とはどのようなデータベースですか?

GTEx は、ヒト組織サンプルからの遺伝子発現データを含む包括的なデータベースです。その内容には、53 種類の組織からの RNA 配列、eQTL データ、およびその他の関連情報が含まれます。用途には、組織特異的な遺伝子発現の理解、疾患関連遺伝子の同定、遺伝子制御の研究、個別化医療の開発などが含まれます。

GTEx データベースとは何ですか?

GTEx (遺伝子発現組織学) データベースは、ヒト組織サンプルの遺伝子発現データと関連情報を含む包括的なリソースです。

データベースの内容:

GTEx データベースは 700 人を超えるドナーからサンプルを収集し、すべての主要な臓器と組織を含む 53 の組織タイプをカバーしています。サンプルは、15,000 を超える RNA 配列 (RNA-Seq) およびマイクロアレイ データセットに編成されました。

データ型:

• 遺伝子発現: 各組織における遺伝子の発現レベルを記録します。
• eQTL データ: 遺伝子発現に影響を与える特定の遺伝的変異を特定します。
• その他の関連データ: 組織学的情報、臨床表現型、およびトランスクリプトーム情報が含まれます。

目的:

GTEx データベースは、生物医学研究に貴重なリソースを提供します。これは次の目的で使用できます:

• 組織特異的な遺伝子発現の理解:さまざまな組織タイプにおけるさまざまな遺伝子の発現パターンを決定します。
• 疾患関連遺伝子の特定: 疾患患者と健康な人の遺伝子発現を比較することにより、疾患関連遺伝子を特定します。
• 遺伝子制御の研究: eQTL データを使用して、遺伝子発現に影響を与える遺伝的要因を研究します。
• 個別化医療の開発: 組織特異的な遺伝子発現を分析することで、特定の組織を標的とする治療法を開発します。

データ アクセス:

GTEx データベースのデータは、公式 Web サイトから無料で入手できます。ユーザーは、組織の種類、遺伝子、またはその他のメタデータによってデータセットをフィルタリングできます。

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