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Volcano Engine は、Shenzhen Technology が業界初の 3D 分子事前トレーニング モデル Uni-Mol をリリースするのに役立ちます

王林
王林転載
2023-04-13 10:10:131748ブラウズ

新薬の継続的な出現により、人間の生活の質と平均寿命はある程度改善されました。創薬の分野では、創薬分子と多様な構造の組み合わせが数千万通りあるため、創薬候補の化学空間は非常に大きくなっています。

#医薬品の設計をスピードアップするにはどうすればよいでしょうか? 2018 年に設立された Shenzhen Technology は、人工知能と分子シミュレーション アルゴリズムを高度なコンピューティング手法と組み合わせて使用​​し、この重要な科学的問題を解決することに取り組んでいます。

分子シミュレーション アルゴリズムの課題

Shenzhen Technology は、「科学のための AI」科学研究パラダイムの実践者であり、最先端のモデルです。基礎的な生物医学、エネルギー、材料、情報科学と工学の研究は、新世代のマイクロスケールの工業デザインとシミュレーション プラットフォームを生み出します。

#このハイテク企業は、強力な科学研究と産業実装能力を備えています。たとえば、医学の分野では、Shenzhen Technology は、自由エネルギー摂動理論、分子動力学、強化されたサンプリング アルゴリズムと、Hermite Uni-FEP、Uni-Fold、RiD およびその他のモジュールによる高性能コンピューティングを組み合わせて、タンパク質の構造と構造変化を正確に予測します。 、タンパク質とリガンドの結合自由エネルギーを化学的精度で効率的に評価し、医薬品開発者に効率的かつ正確な理論的ガイダンスを提供し、医薬品の設計と最適化の効率を向上させます。

#分子シミュレーション アルゴリズムはコンピューティング能力やその他のリソースに線形的に依存するため、Shenzhen Technology は、基礎となるリソースのスケジューリングとアルゴリズムの最適化に関して次の課題に直面しています。

  1. ##コンピューティング タスクの数は大きく、大きく変動するため、基盤となるプラットフォームには柔軟で効率的な柔軟なスケジューリング機能が必要です。
  2. 大規模なモデル、大規模なメモリのトレーニング;
  3. 大量の非構造化ファイル データの読み取り;
# Shenzhen Technology は、効率的で信頼性が高く、柔軟なハイパフォーマンス コンピューティング サービスを得るために、Volcano Engine と協力することを選択しました。

業界初の 3 次元分子事前トレーニング モデル

Volcano Engine は、深センテクノロジーに GPU アクセラレーションに基づく科学計算ソリューションを提供しますビジネス トラフィックに基づいて容量を自動的に柔軟に拡張し、各ノードの健全性状態を自動的に収集し、対応する自己修復戦略を策定して、インテリジェントな運用と保守を実現できます。たとえば、ノードが利用できない場合、このソリューションはノード上のコンテナを置き換えて再スケジュールし、ビジネスのスムーズで健全な運営を保証します。

Volcano Engine は、Shenzhen Technology が業界初の 3D 分子事前トレーニング モデル Uni-Mol をリリースするのに役立ちます 科学技術コンピューティング ソリューションは、Volcano Engine のクラウドベースの製品に依存し、弾力的に拡張可能な高速コンピューティング サーバー GPU と高性能 A を提供します。ファイル サービス クラスターと超高同時実行スループットの並列ファイル ストレージを、AI や科学技術コンピューティングなどのハイ パフォーマンス コンピューティング シナリオ向けに特別に設計された機械学習プラットフォームと組み合わせることで、Shenzhen Technology はコア ビジネスの開発に集中できるようになります。

Shenzhen Technology の担当者は次のように述べています。「科学計算ソリューションを使用した後は、基盤となるサーバーなどのインフラストラクチャを直接購入して管理する必要がなく、アプリケーション自体の構築に集中できます」 IT メンテナンス コストを効果的に削減します。」

#Volcano Engine 科学計算ソリューションは、深セン技術の研究開発の進捗を効果的に保証します。最近、Shenshi Technology は初の 3 次元分子事前トレーニング モデル Uni-Mol (https://github.com/dptech-corp/Uni-Mol) をリリースしました。

Uni-Mol フレームワーク図

Volcano Engine は、Shenzhen Technology が業界初の 3D 分子事前トレーニング モデル Uni-Mol をリリースするのに役立ちます

Uni-Mol は分子を直接接続します1 次元シーケンスや 2 次元グラフ構造ではなく、3 次元構造がモデル入力として使用されます。三次元情報に基づく表現学習により、Uni-Mol は薬物分子やタンパク質ポケットに関連するほぼすべての下流タスクで SOTA (最先端) を超えることができ、分子立体構造の生成を直接完了することもできます。タンパク質とリガンドの結合による立体構造予測や 3D 立体構造生成に関連するその他のタスクを実現し、既存のソリューションを超えます。


将来的には、Shenzhen Technology は、Volcano Engine プラットフォームに基づいた一連のタンパク質自由エネルギーおよび絶対自由エネルギー計算機能も発売し、革新的なソリューションを提供する予定です。高度な生産性ツールは、医薬品やその他の設計設計の開発を加速します。

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