Installation CentOS MUMmer et méthode d'installation

l'éditeur php Xiaoxin vous propose un tutoriel détaillé sur l'installation de MUMmer sur CentOS. MUMmer est un outil de comparaison de séquences génomiques et est largement utilisé dans le domaine de la bioinformatique. Cet article présentera la méthode d'installation de MUMmer, y compris les environnements de dépendances nécessaires et les étapes d'installation spécifiques. En suivant les étapes fournies dans cet article, vous pourrez installer avec succès MUMmer sur votre système CentOS et être prêt pour les travaux ultérieurs de comparaison du génome. Apprenons ensemble !

Avant d'installer un logiciel, vous devez d'abord mettre à jour le système pour vous assurer que les packages logiciels utilisés lors de l'installation sont les dernières versions. Ouvrez un terminal et exécutez la commande suivante en tant qu'utilisateur root :

```

. yum update

Cette commande vérifiera et mettra à jour tous les packages du système.

MUMmer dépend de certains autres packages logiciels, nous devons donc d'abord installer ces packages de dépendances. Exécutez la commande suivante pour installer les packages logiciels requis :

yum install gcc make zlib-devel

Ces packages fourniront les outils nécessaires pour. compiler et exécuter les fonctions nécessaires de MUMmer.

Avant d'installer MUMmer, nous devons télécharger le code source de MUMmer depuis le site officiel, ouvrir un navigateur Web, visiter le site officiel de MUMmer () et télécharger la dernière version du code source.

Une fois le téléchargement terminé, décompressez le code source dans le répertoire de votre choix. Dans le terminal, passez au répertoire du code source décompressé et exécutez les commandes suivantes pour compiler et installer MUMmer :

make check

make install

.

ces La commande compilera et installera MUMmer sur votre système.

Une fois l'installation terminée, vous pouvez vérifier si MUMmer a été installé avec succès en exécutant la commande suivante :

nucmer --version

Si l'installation réussit, les informations de version de MUMmer s'afficheront.

Cet article explique comment installer MUMmer sur CentOS. En mettant à jour le système, en installant les dépendances nécessaires, en téléchargeant le code source, en compilant et en installant MUMmer, vous pouvez installer et utiliser avec succès MUMmer sur CentOS pour l'alignement du génome et l'analyse des séquences.

Dans le système d'exploitation Linux, vous pouvez utiliser la commande `chmod` pour modifier les autorisations des fichiers ou des répertoires. En définissant différentes autorisations, vous pouvez contrôler les autorisations d'accès aux fichiers ou aux répertoires. Les autorisations sont divisées en trois niveaux : propriétaire, groupe. Groupes et autres utilisateurs, la commande `chmod` utilise différents paramètres pour définir différentes autorisations, par exemple `chmod +x file` signifie définir le fichier comme autorisations exécutables.

Ce qui précède est le contenu détaillé de. pour plus d'informations, suivez d'autres articles connexes sur le site Web de PHP en chinois!