Pourquoi ne puis-je pas allouer un grand tableau Numpy et comment puis-je y remédier ?

Impossible d'allouer un grand tableau dans Numpy : comprendre l'erreur et sa résolution

Le problème de faire face à un "Impossible d'allouer un tableau avec une forme et l'erreur "type de données" lors de la tentative de création d'un grand tableau Numpy peut être attribuée au mode de gestion de surcharge du système.

Gestion de la surcharge de mémoire

Dans les systèmes Linux, la gestion de la surcharge de mémoire détermine la manière dont le système gère l'allocation de mémoire. Le mode Overcommit 0, la valeur par défaut, limite les demandes de mémoire excessives pour garantir la stabilité du système. Lorsque la limite de surcharge est atteinte, l'allocation de mémoire peut échouer.

Le cas de l'allocation de grands tableaux

Lors de l'allocation d'un grand tableau dans Numpy, comme dans l'exemple fourni avec une forme de (156816, 36, 53806), la taille de la mémoire requise dépasse largement la mémoire physique disponible. Dans le cas donné, cela s'élève à environ 282 Go.

Mode mémoire surchargée

La solution à cette erreur réside dans l'activation du mode "Toujours surcharger" en définissant / proc/sys/vm/overcommit_memory sur 1. Cela remplace l'heuristique par défaut et autorise les allocations de mémoire indépendamment des ressources physiques disponibles. mémoire.

Tableaux clairsemés et allocation de mémoire

Il est important de noter que l'activation du mode de surcharge n'alloue pas de mémoire physique pour l'ensemble de la baie en même temps. Au lieu de cela, la mémoire est allouée au fur et à mesure que les pages y sont écrites. Cela signifie que si le tableau est clairsemé, avec une majorité de zéro élément, l'utilisation réelle de la mémoire sera nettement inférieure à la taille théorique.

Attention et considérations

Bien que l’activation du mode overcommit résolve le problème d’allocation, il doit être utilisé avec prudence. Des allocations de mémoire excessives peuvent entraîner une dégradation des performances du système si les ressources disponibles sont dépassées. De plus, il est essentiel de faire correspondre le paramètre de surengagement avec la disponibilité réelle des ressources pour éviter une instabilité potentielle du système.

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