atom保存时自动清理行尾空格主要由whitespace插件的trim_trailing_whitespace选项控制，需在插件设置中取消勾选；同时检查.editorconfig是否覆盖配置，并排查prettier-atom等格式化插件干扰。
Atom 保存时自动清理行尾空格，基本就是 whitespace 插件在干活——它默认开启 trim_trailing_whitespace，一保存就抹掉每行末尾所有空格。这不是 bug，但会破坏 Markdown 换行（需两个空格）、Python 字符串校验、日志字段对齐等场景。
怎么关掉 whitespace 的自动清理
这是最直接的控制点，90% 的问题出在这儿：
- 打开 【Edit】→【Preferences】→【Packages】，搜索
whitespace - 点进它的 Settings，取消勾选
Trim Trailing Whitespace - 如果是 Markdown 文件，顺手勾上
Keep Markdown Line Break Whitespace，它会特例放过行尾两个空格
检查 .editorconfig 是否覆盖了设置
哪怕 whitespace 插件关了，只要项目根目录有 .editorconfig 文件，且里面写了 trim_trailing_whitespace = true，Atom 就会照做——editorconfig 插件优先级更高。
- 打开
.editorconfig，搜trim_trailing_whitespace - 想全局禁用，改成
trim_trailing_whitespace = false - 只想对某类文件禁用，加段落，比如：
[*.md]\ntrim_trailing_whitespace = false
留意其他格式化插件的干扰
prettier-atom、atom-beautify 或 clang-format 这类插件，可能在保存时顺手“整理”空格，它们的规则不经过 whitespace 插件，也无视 .editorconfig 的 trim_trailing_whitespace。
- 临时禁用这些插件，只留
whitespace和editorconfig - 保存测试，看空格是否还消失；若不再消失，说明是它们在介入
- 去对应插件设置里找类似
removeTrailingSpaces或trimTrailingWhitespace的开关关掉
真正麻烦的是多层配置叠加：插件开关、.editorconfig、其他格式化工具，三者都可能生效，而且优先级不透明。调一个地方没用，得挨个排查，尤其注意 .editorconfig 是静默接管，根本不会提示你它正在起作用。
