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【Sesame】TripleStore添加三元数据

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2016-06-07 15:28:371455browse

打算写一个sesame数据库的使用系列文章。这是第二篇,第一篇详见这里,讲解sesame数据库的搭建。 Sesame数据库添加triple三元组的方法有很多种,这里讲解两种,即单条添加与批量添加。 1. 建立数据库链接 Sesame数据库提供了几种数据存储办法,有本地数据库N

打算写一个sesame数据库的使用系列文章。这是第二篇,第一篇详见这里,讲解sesame数据库的搭建。

Sesame数据库添加triple三元组的方法有很多种,这里讲解两种,即单条添加与批量添加。

1. 建立数据库链接

Sesame数据库提供了几种数据存储办法,有本地数据库NativeStore,有基于内存的MemoryStore,有基于远程数据库的HTTP方式,还有基于关系型数据库存储方式的MySQLStore.
声明变量:
private Repository repo;
	private MemoryStore memStore;
	private NativeStore natStore;
	private File repoFile;
	private RepositoryConnection repoConn;

基于内存MemoryStore:
	/**
	 * To get the repository within memory.
	 */
	public RepoUtil() {
		repoFile = new File(Const.repoPath);
		memStore = new MemoryStore();
		repo = new SailRepository(memStore);
	}

基于本地NativeStore:
	/**
	 * To get the repository on the disk.
	 * @param repoPath the repository file path
	 */
	public RepoUtil(String repoPath) {
		repoFile = new File(repoPath);
		natStore = new NativeStore(repoFile);
		repo = new SailRepository(natStore);
	}

基于网络HTTP Connection:
	/**
	 * To get the repository on the Http server.
	 * @param server the server address
	 * @param repoId the repository ID
	 */
	public RepoUtil(String server, String repoId) {
		repo = new HTTPRepository(server, repoId);
	}

基于关系型数据库MySQL:参考我的另一篇文章.

1.1. 初始化数据库

try {
			repo.initialize();
			repoConn = repo.getConnection();//Get the connection from repository connection pool
//			repoConn.setAutoCommit(false);//why deprecate the setAutoCommit method?
		} catch(RepositoryException e) {
			e.printStackTrace();
		}


2. 添加单条数据

2.1. 生成URI

此处提供函数用于生成URI,不需要如此麻烦,领会URI生成方法要领即可。先需要初始化URI、Literal生成器ValueFactory:
ValueFactory valueFactory = new ValueFactoryImpl();

接下来即可生成URI:
	/**
	 * To get the URI of the specific string value
	 * 1. if it is already a URI, then return;
	 * 2. else translate it to URI format and return.
	 * @param iden
	 * @return the true URI
	 */
	public URI getUri(String iden) {
		URI rtn = null;
		String url = null;
		StringBuilder strRtn = new StringBuilder(uriBuilder);
		if(isUri(iden)) {
			System.out.println("isUri");
			return valueFactory.createURI(iden);
		} else {
			try {
				url = URLEncoder.encode(iden,"utf-8");
			} catch (UnsupportedEncodingException e) {
				e.printStackTrace();
			}
			strRtn.append(url);
			rtn = valueFactory.createURI(strRtn.toString());
			return rtn;
		}
	}

此处附上判断URI的函数(摘自网络)
	/**
	 * To justify if the input string is 
	 * in the format of URI.
	 * @param obj
	 * @return
	 */
	public boolean isUri(String obj) {
		return obj.matches("(([a-zA-Z][0-9a-zA-Z+\\\\-\\\\.]*:)?/{0,2}[0-9a-zA-Z;/?:@&=+$\\\\.\\\\-_!~*'()%]+)?(#[0-9a-zA-Z;/?:@&=+$\\\\.\\\\-_!~*'()%]+)?");
//		return false;
	}

生成URI与Literal方法的简化版(会忽略某些问题,建议采用以上函数):
URI creativeWork = vf.createURI(namespace+"CreativeWork");
Literal about = vf.createLiteral(namespace+"about#"+"SomeString");

在构建好Connection、URI以及Literal以后,即可插入三元组:
	/**
	 * The URI-URI-Literal format SPO record.
	 */
	public void addRecord(URI subj, URI pred, Literal obj) {
		try {
//			repoConn = repo.getConnection();
			repoConn.add(subj, pred, obj);
//			repoConn.close();
		} catch (RepositoryException e) {
			e.printStackTrace();
		} 
	}
	
	/**
	 * The URI-URI-URI format SPO record.
	 */
	public void addRecord(URI subj, URI pred, URI obj) {
		try {
//			repoConn = repo.getConnection();
			repoConn.add(subj, pred, obj);
//			repoConn.close();
		} catch (RepositoryException e) {
			e.printStackTrace();
		}
	}

3、批量导入数据

如果有大量数据已经在文件中保存,我们不需要人工编写数据读取、写入的代码,直接通过Sesame已经提供的批量导入接口即可。
				File importFile = new File("segment"+j+".ttl");
				String baseURI = "http://rk.com/import/test/";
				RepositoryConnection con;
				try {
					FileReader fileReader = new FileReader(importFile);
					BufferedReader reader = new BufferedReader(fileReader);
					con = repo.getConnection();
					con.add(reader, baseURI, RDFFormat.TURTLE);
					System.out.println("Add "+j+" ends.");

					con.close();
				} catch (RepositoryException e) {
					e.printStackTrace();
				} catch (RDFParseException e) {
					e.printStackTrace();
				} catch (IOException e) {
					e.printStackTrace();
				} 

注意Java Heap的内存大小限制。可以查看这里修改Java虚拟机内存限制。
至此完成了Sesame数据写入的几种方法。下回介绍数据导出与数据修改。
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