Welche Software ist Rosetta?

Rosetta ist ein umfassender Softwaresatz zur Simulation makromolekularer Strukturen. Die Software wurde erstmals 1998 in FORTRAN für die Abinitio-Vorhersage kleiner Proteine ​​geschrieben und wurde nun in „C++“ als flexible, vielseitige Anwendung umgeschrieben Strukturvorhersage, Design und Umgestaltung von Proteinen und Nukleinsäuren.

Die Betriebsumgebung dieses Tutorials: Windows 10-System, DELL G3-Computer.

Welche Software ist Rosetta?

Rosetta ist eine umfassende Software zur Simulation makromolekularer Strukturen. Es wurde erstmals 1998 in FORTRAN geschrieben und zur Abinitio-Vorhersage kleiner Proteine ​​verwendet. Jetzt in C++ als flexible, vielseitige Anwendung neu geschrieben, enthält es Werkzeuge für die Strukturvorhersage, das Design und die Umformung von Proteinen und Nukleinsäuren. Der Webserver von Rosetta hat Milliarden von Simulationen zur Strukturvorhersage und zum Proteindesign ausgeführt.

Auf den Webservern von Rosetta wurden Milliarden von Strukturvorhersage- und Proteindesignsimulationen ausgeführt, und Milliarden oder sogar Billionen mehr laufen auf Supercomputer-Clustern.

Forscher nutzen Rosetta, um Behandlungen für Infektionskrankheiten, Krebs und Autoimmunerkrankungen besser zu verstehen. Weitere Anwendungen umfassen die Entwicklung von Impfstoffen, neuen Materialien, gezielten Proteinbindern und dem Enzymdesign.

Rosetta war ursprünglich ein Strukturvorhersagetool und hat im CASP-Community-weiten Blindvorhersagetraining durchweg gute Leistungen erbracht. Es ist gewachsen und bietet eine Vielzahl effizienter Sampling-Algorithmen zur Erkundung des Backbone-, Side-Chain- und Sequenzraums, und seine Vorteile wurden auf gemeinschaftlichere Übungen wie RNA-Rätsel und CAPRI verallgemeinert. Rosetta hat die Energiebewertungsfunktionen umfassend getestet und umfasst ein beispielloses Anwendungsspektrum vom Zusammenklappen über das Andocken bis hin zum Design.

Rosetta ist für akademische und staatliche Labore kostenlos verfügbar und es werden über 10.000 kostenlose Lizenzen verwendet. Enthält auch ein aktives Forum. Um Rosetta herunterzuladen, beantragen Sie bitte eine Lizenz.

Wenn Sie bereit sind, Rosetta auszuprobieren, empfehle ich Ihnen, hier zu beginnen und diese Tutorials auszuprobieren.

Weitere Informationen zu diesem Thema finden Sie in der Spalte „FAQ“!

Das obige ist der detaillierte Inhalt vonWelche Software ist Rosetta?. Für weitere Informationen folgen Sie bitte anderen verwandten Artikeln auf der PHP chinesischen Website!