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Ein einfaches Tutorial zur Verwendung von Python für die Datenanalyse

高洛峰
高洛峰Original
2017-01-13 12:54:222103Durchsuche

Kürzlich wurde Planet Python von Analysis with Programming hinzugefügt. Als einer der ersten Gastblogger auf dieser Website möchte ich Ihnen mitteilen, wie Sie mit der Datenanalyse mit Python beginnen. Die spezifischen Inhalte sind wie folgt:

Datenimport
Importieren von lokalen oder Web-CSV-Dateien;
Datenstatistische Beschreibung
Einzelstichproben-T -test;
Visualisierung;
Benutzerdefinierte Funktionen erstellen.


Datenimport

Für die anschließende Analyse müssen wir zunächst die Daten importieren. Im Allgemeinen liegen die Daten im CSV-Format vor, und selbst wenn dies nicht der Fall ist, können sie zumindest in das CSV-Format konvertiert werden. In Python lauten unsere Vorgänge wie folgt:

Um lokale CSV-Dateien zu lesen, benötigen wir das entsprechende Modul in der Pandas-Datenanalysebibliothek. Die Funktion read_csv kann lokale und Webdaten lesen.
import pandas as pd
  
# Reading data locally
df = pd.read_csv('/Users/al-ahmadgaidasaad/Documents/d.csv')
  
# Reading data from web
data_url = "https://raw.githubusercontent.com/alstat/Analysis-with-Programming/master/2014/Python/Numerical-Descriptions-of-the-Data/data.csv"
df = pd.read_csv(data_url)


Datentransformation

Da nun Daten im Arbeitsbereich vorhanden sind, ist der nächste Schritt die Datentransformation. Statistiker und Wissenschaftler entfernen in diesem Schritt häufig unnötige Daten aus der Analyse. Werfen wir zunächst einen Blick auf die Daten:

Für R-Sprachprogrammierer entspricht der obige Vorgang dem Drucken der ersten 6 Datenzeilen über print(head(df)) und dem Drucken der ersten 6 Datenzeilen über print(tail( df)), um die letzten 6 Datenzeilen zu drucken. In Python sind es natürlich standardmäßig 5 Zeilen, während es in R 6 Zeilen sind. Daher ist der R-Code head(df, n = 10) in Python df.head(n = 10), und das Gleiche gilt für das Drucken des Endes der Daten.
# Head of the data
print df.head()
  
# OUTPUT
 Abra Apayao Benguet Ifugao Kalinga
0 1243 2934  148 3300 10553
1 4158 9235  4287 8063 35257
2 1787 1922  1955 1074  4544
3 17152 14501  3536 19607 31687
4 1266 2385  2530 3315  8520
  
# Tail of the data
print df.tail()
  
# OUTPUT
  Abra Apayao Benguet Ifugao Kalinga
74 2505 20878  3519 19737 16513
75 60303 40065  7062 19422 61808
76 6311 6756  3561 15910 23349
77 13345 38902  2583 11096 68663
78 2623 18264  3745 16787 16900

In der R-Sprache werden die Namen von Datenspalten und -zeilen durch Spaltennamen bzw. Zeilennamen extrahiert. In Python verwenden wir die Spalten und Indexattribute zum Extrahieren wie folgt:

Datentransposition verwendet die T-Methode,
# Extracting column names
print df.columns
  
# OUTPUT
Index([u'Abra', u'Apayao', u'Benguet', u'Ifugao', u'Kalinga'], dtype='object')
  
# Extracting row names or the index
print df.index
  
# OUTPUT
Int64Index([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78], dtype='int64')

Andere Transformationen, wie z. B. Sortieren, verwenden die Sortierattribut. Jetzt extrahieren wir eine bestimmte Datenspalte. In Python können Sie iloc- oder ix-Attribute verwenden. Aber ich verwende lieber ix, weil es stabiler ist. Angenommen, wir benötigen die ersten 5 Zeilen der ersten Datenspalte, dann haben wir:
# Transpose data
print df.T
  
# OUTPUT
   0  1  2  3  4  5  6  7  8  9
Abra  1243 4158 1787 17152 1266 5576 927 21540 1039 5424
Apayao 2934 9235 1922 14501 2385 7452 1099 17038 1382 10588
Benguet 148 4287 1955 3536 2530 771 2796 2463 2592 1064
Ifugao 3300 8063 1074 19607 3315 13134 5134 14226 6842 13828
Kalinga 10553 35257 4544 31687 8520 28252 3106 36238 4973 40140
  
   ...  69  70  71  72  73  74  75  76  77
Abra  ... 12763 2470 59094 6209 13316 2505 60303 6311 13345
Apayao ... 37625 19532 35126 6335 38613 20878 40065 6756 38902
Benguet ...  2354 4045 5987 3530 2585 3519 7062 3561 2583
Ifugao ...  9838 17125 18940 15560 7746 19737 19422 15910 11096
Kalinga ... 65782 15279 52437 24385 66148 16513 61808 23349 68663
  
   78
Abra  2623
Apayao 18264
Benguet 3745
Ifugao 16787
Kalinga 16900

Übrigens beginnt der Index von Python bei 0 statt bei 1. Um die ersten 3 Datenspalten aus den Zeilen 11 bis 20 zu erhalten, haben wir:
print df.ix[:, 0].head()
  
# OUTPUT
0  1243
1  4158
2  1787
3 17152
4  1266
Name: Abra, dtype: int64

Der obige Befehl entspricht df.ix[10:20, ['Abra', 'Apayao' , 'Benguet'] ].
print df.ix[10:20, 0:3]
  
# OUTPUT
 Abra Apayao Benguet
10 981 1311  2560
11 27366 15093  3039
12 1100 1701  2382
13 7212 11001  1088
14 1048 1427  2847
15 25679 15661  2942
16 1055 2191  2119
17 5437 6461  734
18 1029 1183  2302
19 23710 12222  2598
20 1091 2343  2654

Um Spalten in den Daten zu löschen, hier sind Spalte 1 (Apayao) und Spalte 2 (Benguet), verwenden wir das Drop-Attribut wie folgt:

Der Achsenparameter gibt an Funktion genau, welche Spalten gelöscht werden sollen. Wenn die Achse gleich 0 ist, werden die Zeilen verworfen.
print df.drop(df.columns[[1, 2]], axis = 1).head()
  
# OUTPUT
 Abra Ifugao Kalinga
0 1243 3300 10553
1 4158 8063 35257
2 1787 1074  4544
3 17152 19607 31687
4 1266 3315  8520

Statistische Beschreibung

Der nächste Schritt besteht darin, die statistischen Eigenschaften der Daten durch das Beschreibungsattribut zu beschreiben:

Hypothesentest
print df.describe()
  
# OUTPUT
    Abra  Apayao  Benguet  Ifugao  Kalinga
count  79.000000  79.000000 79.000000  79.000000  79.000000
mean 12874.379747 16860.645570 3237.392405 12414.620253 30446.417722
std 16746.466945 15448.153794 1588.536429 5034.282019 22245.707692
min  927.000000 401.000000 148.000000 1074.000000 2346.000000
25%  1524.000000 3435.500000 2328.000000 8205.000000 8601.500000
50%  5790.000000 10588.000000 3202.000000 13044.000000 24494.000000
75% 13330.500000 33289.000000 3918.500000 16099.500000 52510.500000
max 60303.000000 54625.000000 8813.000000 21031.000000 68663.000000

Python hat ein sehr gutes statistisches Inferenzpaket. Das sind die Statistiken in Scipy. ttest_1samp implementiert den t-Test bei einer Stichprobe. Wenn wir daher den durchschnittlichen Reisertrag der Abra-Spalte der Daten testen möchten und die Nullhypothese erfüllen, gehen wir hier davon aus, dass der durchschnittliche Gesamtreisertrag 15.000 beträgt. Wir haben:

Gibt den zurück Vorfahr bestehend aus den folgenden Werten:
from scipy import stats as ss
  
# Perform one sample t-test using 1500 as the true mean
print ss.ttest_1samp(a = df.ix[:, 'Abra'], popmean = 15000)
  
# OUTPUT
(-1.1281738488299586, 0.26270472069109496)

t: Gleitkomma- oder Array-Typ

t-Statistik

prob: Gleitkomma- oder Array-Typ
zweiseitiger p-Wert zweiseitiger Wahrscheinlichkeitswert

Durch die obige Ausgabe ist zu sehen, dass der p-Wert 0,267 ist, viel größer als α gleich 0,05, sodass es keine ausreichenden Beweise dafür gibt, dass der durchschnittliche Reisertrag nicht 150.000 beträgt. Wenn wir diesen Test auf alle Variablen anwenden und wiederum einen Mittelwert von 15.000 annehmen, erhalten wir:

Das erste Array ist die t-Statistik und das zweite Array ist der entsprechende p-Wert.
print ss.ttest_1samp(a = df, popmean = 15000)
  
# OUTPUT
(array([ -1.12817385, 1.07053437, -65.81425599, -4.564575 , 6.17156198]),
 array([ 2.62704721e-01, 2.87680340e-01, 4.15643528e-70,
   1.83764399e-05, 2.82461897e-08]))

Visualisierung


Es gibt viele Visualisierungsmodule in Python, das beliebteste ist die Matpalotlib-Bibliothek. Als kurze Erwähnung können wir auch die Module Bokeh und Seaborn wählen. In einem früheren Blogbeitrag habe ich die Funktionalität des Box-and-Whisker-Plotmoduls in der Matplotlib-Bibliothek erklärt.

Ein einfaches Tutorial zur Verwendung von Python für die Datenanalyse

Jetzt können wir das in R im Pandas-Modul integrierte ggplot-Theme verwenden, um das Diagramm zu verschönern. Um ggplot zu verwenden, müssen wir dem obigen Code nur eine weitere Zeile hinzufügen,
# Import the module for plotting
import matplotlib.pyplot as plt
 plt.show(df.plot(kind = 'box'))

, sodass wir das folgende Diagramm erhalten:
import matplotlib.pyplot as plt
pd.options.display.mpl_style = 'default' # Sets the plotting display theme to ggplot2
df.plot(kind = 'box')

Ein einfaches Tutorial zur Verwendung von Python für die Datenanalyse als matplotlib.pyplot-Thema Zu viel Einfachheit. In diesem Blogbeitrag möchte ich jedoch lieber das Seaborn-Modul vorstellen, bei dem es sich um eine Bibliothek zur statistischen Datenvisualisierung handelt. Wir haben also:

Ein einfaches Tutorial zur Verwendung von Python für die Datenanalyse

Was für eine sexy Boxkunst, lesen Sie weiter.
# Import the seaborn library
import seaborn as sns
 # Do the boxplot
plt.show(sns.boxplot(df, widths = 0.5, color = "pastel"))

plt.show(sns.violinplot(df, widths = 0.5, color = "pastel"))

Ein einfaches Tutorial zur Verwendung von Python für die Datenanalyse

plt.show(sns.distplot(df.ix[:,2], rug = True, bins = 15))

Ein einfaches Tutorial zur Verwendung von Python für die Datenanalyse

with sns.axes_style("white"):
 plt.show(sns.jointplot(df.ix[:,1], df.ix[:,2], kind = "kde"))

Ein einfaches Tutorial zur Verwendung von Python für die Datenanalyse

plt.show(sns.lmplot("Benguet", "Ifugao", df))

创建自定义函数

在Python中,我们使用def函数来实现一个自定义函数。例如,如果我们要定义一个两数相加的函数,如下即可:

def add_2int(x, y):
 return x + y
  
print add_2int(2, 2)
  
# OUTPUT
4

顺便说一下,Python中的缩进是很重要的。通过缩进来定义函数作用域,就像在R语言中使用大括号{…}一样。这有一个我们之前博文的例子:

    产生10个正态分布样本,其中u=3和o.
    基于95%的置信度,计算 x_bar 和 x_bar2 ;
    重复100次; 然后
    计算出置信区间包含真实均值的百分比

Python中,程序如下:

import numpy as np
import scipy.stats as ss
  
def case(n = 10, mu = 3, sigma = np.sqrt(5), p = 0.025, rep = 100):
 m = np.zeros((rep, 4))
  
 for i in range(rep):
  norm = np.random.normal(loc = mu, scale = sigma, size = n)
  xbar = np.mean(norm)
  low = xbar - ss.norm.ppf(q = 1 - p) * (sigma / np.sqrt(n))
  up = xbar + ss.norm.ppf(q = 1 - p) * (sigma / np.sqrt(n))
  
  if (mu > low) & (mu < up):
   rem = 1
  else:
   rem = 0
  
  m[i, :] = [xbar, low, up, rem]
  
 inside = np.sum(m[:, 3])
 per = inside / rep
 desc = "There are " + str(inside) + " confidence intervals that contain "
   "the true mean (" + str(mu) + "), that is " + str(per) + " percent of the total CIs"
  
 return {"Matrix": m, "Decision": desc}

   

上述代码读起来很简单,但是循环的时候就很慢了。下面针对上述代码进行了改进,这多亏了 Python专家。

import numpy as np
import scipy.stats as ss
  
def case2(n = 10, mu = 3, sigma = np.sqrt(5), p = 0.025, rep = 100):
 scaled_crit = ss.norm.ppf(q = 1 - p) * (sigma / np.sqrt(n))
 norm = np.random.normal(loc = mu, scale = sigma, size = (rep, n))
  
 xbar = norm.mean(1)
 low = xbar - scaled_crit
 up = xbar + scaled_crit
  
 rem = (mu > low) & (mu < up)
 m = np.c_[xbar, low, up, rem]
  
 inside = np.sum(m[:, 3])
 per = inside / rep
 desc = "There are " + str(inside) + " confidence intervals that contain "
   "the true mean (" + str(mu) + "), that is " + str(per) + " percent of the total CIs"
 return {"Matrix": m, "Decision": desc}

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