php.ini 或 php3.ini 是 PHP 在启动时会读取的配置文件。该文件的存放路径为 /usr/local/lib/。在 PHP 3.x 版的配置文件为 php3.ini；而在 PHP 4.x 版改为 php.ini。若 PHP 安装成服务器的模块，则在 Web 服务器启动执行时会读取，之后就不再读取，因此改动配置的话要重新启动 Web 服务器。若使用独立 PHP CGI 方式，则每次都读一次。
要看目前的系统配置，可以用phpinfo()看到。以下为选项配置
php_value name value
配置变量名称和值。本选项需 PHP 4.x 版之后才能使用。
php_flag name on|off
配置标志布尔变量选项。本选项需 PHP 4.x 版之后才能使用。
php_admin_value name value
配置 Apache 的配置文件变量。原来在 .htaccess 的配置改到这个选项配置。本选项需 PHP 4.x 版之后才能使用。
php_admin_flag name on|off
配置布尔变量当标志。本选项需 PHP 4.x 版之后才能使用。
asp_tags boolean
配置 PHP 程序是否解析以 ASP Script 语法 的标记 (tag)。本选项在 PHP 3.0.4 之后才可使用。更多的细节可以参考>嵌入方法的部份。
auto_append_file string
配置本选项可以让指定的文件附加在原 PHP 程序后面自动执行。若 PHP 程序中有用到 exit() 函数，则指定的文件不会执行。参数 string 即为指定自动执行的文件。
auto_prepend_file string
配置本选项可以让指定的文件在原 PHP 程序之前自动执行。参数 string 即为指定自动执行的文件。
cgi_ext string
本选项配置 CGI 程序的扩展名。
display_errors boolean
本选项配置是否要将执行的错误信息显示在用户的浏览器上。
doc_root string
配置服务器的文件及 PHP 文件放置的根目录。
engine boolean
本选项需要使用apache的模块方式使用 PHP。可配置是否要使用 PHP 引擎。在 httpd.conf 中加入 php3_engine on/off 亦可配置某目录或某虚拟网站是否要用 PHP 解析器。
error_log string
本选项用来配置错误记录文件。在 UNIX 系统上参数 string 即为文件名。Windows NT 会将记录记在事件检视器的日志之中。Windows 95/98 则不支持系统记录。
error_reporting integer
本选项用来配置系统记录的等级。参数 integer 即为等级的级数标志，可以加在一起，默认值为 7，见下表
级数 说明
1 一般的错误
2 一般的警告
4 解析错误
8 非关键的警告
open_basedir string
本选项用来配置提供 PHP 存取的最底层目录。从该指定目录之下的文件或目录，PHP 程序才能存取。使用本选项主要是为了系统安全性的考虑。参数 string 即为要限制的最底层目录节点。值得注意的是在 UNIX 系统中，若该节点之下的文件或目录有符号链结 (symbolic link)，则可能会让使用本选项的目的打折，因此在目录的设计上考虑，也是 Webmaster 的重要任务。默认值是所有文件均可存取。在 PHP 3.0.7 版之后，可以配置多个底层目录。
gpc_order string
配置 GET/POST/COOKIE 三种模块的顺序及规则。参数 string 即为要配置的规则，例如：配置成 "GP" 表示忽视 cookie，并在存取方法 (method) 相同时，以 POST 取代 GET。
ignore_user_abort string
默认值为 Off。用来配置当传输未完成时，用户端断线是要继续处理。
include_path string
为 PHP 程序中 require、include 及 fopen_with_path 等函数的文件搜寻路径。在 UNIX 或 Windows 中的斜线方向不同。
log_errors boolean
指定程序错误时是否要记录在 log 文件中。
magic_quotes_gpc boolean
配置 GET/POST/COOKIE 三种模块的特殊字符，包含单引号、双引号、反斜线、及空字符 (NUL) 是否要自动加入反斜线当溢出字符。
magic_quotes_runtime boolean
配置返回资料是否自动加入反斜线当溢出字符。
magic_quotes_sybase boolean
配置 sybase 资料中单引号要自动加上反斜线当溢出字符。
max_execution_time integer
配置程序最久执行时间。单位是秒。
memory_limit integer
配置程序最多使用多少内存。
short_open_tag boolean
配置是否使用短的 PHP 标记 ( ?>)。若不使用，则必须要用
track_errors boolean
打开本选项可使最后的错误信息跟着全局变量 $php_errormsg。
track_vars boolean
打开本选项可让用户输入的字符串自动解析到变量之中，而不用自己处理。
upload_tmp_dir string
指定上传文件临时路径。
user_dir string
指定用户根目录的路径。
warn_plus_overloading boolean
若打开本选项，字符串间就只能用英文的句号 (.) 链接，而不能用加号 (+) 链接字符串。
SMTP string
在 Windows 系列操作系统中，用来指定 SMTP 服务器，供 mail 函数使用。参数 string 为 SMTP 服务器名字。
sendmail_from string
配置 "From: " 字符串供 Windows 系列操作系统使用 mail 函数。
sendmail_path string
配置 sendmail 程序的放置路径。例如 /usr/sbin/sendmail。
safe_mode boolean
配置 PHP 在安全模式下执行。
safe_mode_exec_dir string
配置安全模式程序执行的路径。
debugger.host string
指定远端调试的服务器名称，可以是 IP 或 Domain Name。
debugger.port string
配置远端调试服务器的端口 (port)。
debugger.enabled boolean
配置是否可以为调试模式。
enable_dl boolean
本选项要使用apache模块 (Apache module) 的方式才有效。用来配置 PHP 的函数可否作用。当系统处于安全模式 (safe-mode) 时，本选项 enable 也无法使用 dl() 函数。
extension_dir string
配置动态函数的路径。
extension string
PHP 启动时所要载入的动态扩充功能。
mysql.allow_persistent boolean
配置是否允许 MySQL 数据库持续连接 (persistent connections)，会影响函数。
mysql.max_persistent integer
配置每个处理程序最多保持几个 MySQL 持续连接。
mysql.max_links integer
配置每个处理程序最多开几个 MySQL 连接，包括持续连接。
msql.allow_persistent boolean
配置是否允许 mSQL 数据库持续连接 (persistent connections)，会影响函数。
msql.max_persistent integer
配置每个处理程序最多保持几个 mSQL 持续连接。
msql.max_links integer
配置每个处理程序最多开几个 mSQL 连接，包括持续连接。
pgsql.allow_persistent boolean
配置是否允许 Postgres 数据库持续连接 (persistent connections)，会影响函数。
pgsql.max_persistent integer
配置每个处理程序最多保持几个 Postgres 持续连接。
pgsql.max_links integer
配置每个处理程序最多开几个 Postgres 连接，包括持续连接。
sybase.allow_persistent boolean
配置是否允许 Sybase 数据库持续连接 (persistent connections)，会影响函数。
sybase.max_persistent integer
配置每个处理程序最多保持几个 Sybase 持续连接。
sybase.max_links integer
配置每个处理程序最多开几个 Sybase 连接，包括持续连接。
sybct.allow_persistent boolean
配置是否允许 Sybase-CT 数据库持续连接 (persistent connections)，默认值是打开的。
sybct.max_persistent integer
配置每个处理程序最多保持几个 Sybase-CT 持续连接。默认值为 -1 表示无限制。
sybct.max_links integer
配置每个处理程序最多开几个 Sybase-CT 连接，包括持续连接。默认值为 -1，表示没有限制。
sybct.min_server_severity integer
配置 Sybase-CT 服务器错误报告的最少笔数。默认值为 10。
sybct.min_client_severity integer
配置 Sybase-CT 客户端错误报告的最少笔数。默认值为 10。
sybct.login_timeout integer
配置 Sybase-CT 最久可以使用的登入时间。默认值为 1 分钟。
sybct.timeout integer
配置 Sybase-CT 的 query 操作时间限制。默认值为无限制。
sybct.hostname string
配置 Sybase-CT 可连接机器名称。默认值不设限
ifx.allow_persistent boolean
配置是否允许 Informix 数据库持续连接 (persistent connections)，会影响函数。
ifx.max_persistent integer
配置每个处理程序最多保持几个 Informix 持续连接。
ifx.max_links integer
配置每个处理程序最多开几个 Informix 连接，包括持续连接。
ifx.default_host string
配置 Informix 默认连接的服务器名称，供ifx_connect()或ifx_pconnect()函数使用。
ifx.default_user string
配置 Informix 默认连接的用户帐号，供ifx_connect()或ifx_pconnect( 函数使用。
ifx.default_password string
配置 Informix 默认连接的用户密码，供ifx_connect()或ifx_pconnect() 函数使用。
ifx.blobinfile boolean
配置 Informix 长位类模式，0 表在内存；1 表在文件中。亦可以在 PHP 程序中使用ifx_blobinfile_mode()函数来修改。
ifx.textasvarchar boolean
配置 Informix 文字模式默认值，0 表返回 blob 的代码；1 表返