1、MySql默认存储引擎的变迁
在MySql5.1之前的版本中，默认的搜索引擎是MyISAM，从MySQL5.5之后的版本中，默认的搜索引擎变更为InnoDB。
2、存储结构
MyISAM：每个MyISAM在磁盘上存储成三个文件。第一个文件的名字以表的名字开始，扩展名指出文件类型。
.frm文件存储表定义；
数据文件的扩展名为.MYD(MYData)；
索引文件的扩展名是.MYI(MYIndex)；
InnoDB：所有的表都保存在同一个数据文件中（也可能是多个文件，或者是独立的表空间文件），InnoDB表的大小只受限于操作系统文件的大小，一般是2GB。
3、存储空间
MyISAM：可被压缩，存储空间较小。支持三种不同的存储格式：静态表（默认，但是注意数据末尾不能有空格，会被去掉）、动态表、压缩表。
InnoDB：需要更锁的内存和存储，它会在主内存中建立其专用的缓冲池用于高速缓冲数据和索引。
4、可移植性、备份与恢复
MyISAM：数据是以文件的形式存储，所以在跨平台的数据转移中会很方便。在备份和恢复时可单独针对某个表进行操作。
InnoDB：免费的方案可以是拷贝数据文件、备份binlog，或者使用mysqldump，在数据量达到几十G的时候就相对痛苦了。
5、事务支持
MyISAM：强调的是性能，每次查询具有原子性，其执行速度相比InnoDB较快，但是不提供事务支持
InnoDB：提供事务支持事务，外部键等高级数据库功能。具有事务提交（commit）、回滚（rollback）和崩溃修复能力（crash recovery capabilities）的事务安全（transaction-safe（ACID compliant））型表。
6、AUTO_INCREMENT
MyISAM：可以和其他字段一起建立联合索引。引擎的自动增长列必须是索引，如果是组合索引，自动增长可以不是第一列，他可以根据前面几列进行排序后递增。
InnoDB：InnoDB中必须包含只有该字段的索引。引擎的自动增长列必须是索引，如果是组合索引也必须是组合索引的第一列。
7、表锁差异
MyISAM：只支持表级锁，用户在操作MyISAM表时，select，update，delete，insert语句都会给表自动加锁，如果加锁以后的表满足insert并发的情况下，可以在表的尾部插入新的数据。
InnoDB：支持事务和行级锁，是InnoDB的最大特色。行锁大幅度提高了多用户并发操作的性能。但是InnoDB的行锁，只是在where的主键是有效的，非主键的where都会锁全表的。
8、全文索引
MyISAM：支持FULLTEXT类型的全文索引
InnoDB：不支持FULLTEXT类型的全文索引，但是InnoDB可以使用sphinx插件支持全文索引，并且效果很好。
9、表主键
MyISAM：允许没有任何索引和主键的表存在，索引都是保存行的地址。
InnoDB：如果没有设定主键或者非空唯一索引，就会自动生成一个6字节的主键（用户不可见），数据是主索引的一部分，附加索引保存的是主索引的值。
10、表的具体行数
MyISAM：保存有表的总行数，如果select count(*) from table;会直接取出该值。
InnoDB：没有保存表的总行数，如果使用select count(*) from table;就会遍历整张表，消耗相当大，但是在家了where条件后，MyISAM和InnoDB的处理方式都一样。
11、CURD操作
MyISAM：如果执行大量的select，MyISAM是更好的选择。
InnoDB：如果执行大量的insert或者update操作，出于性能方面的考虑，应该使用InnoDB表。delete从性能上InnoDB更优，但delete from table时，InnoDB不会重新建立表，而是一行一行的删除，在InnoDB上如果要清空保存有大量数据的表，最好使用truncate table这个命令。
12、外键
MyISAM：不支持
InnoDB：支持
13、总结：
通过上面的分析，基本上可以考虑使用InnoDB来替代MyISAM引擎了，原因是InnoDB自身有很多良好的特点，比如事务支持，存储过程，视图，行级锁定等等，在并发很多的情况下，InnoDB的表现会比MyISAM强很多。另外，任何一种表都不是万能的，只用恰当的针对业务类型来选择合适的表类型，才能最大的发挥MySQL的性能优势。如果不是很复杂的Web应用，非关键应用，还是考虑MyISAM的，需要具体情况具体分析。
14、存储引擎选择的基本原则
采用MyISAM引擎：
R/W > 100:1 且update相对较少
并发不高
表数据量小
硬件资源有限
采用InnoDB引擎
R/W比较小，频繁更新大字段
表数据量超过千万级，并发高
安全性和可用性要求高
采用Memory引擎
有足够的内存
对数据一致性要求不高，如在线人数和session应用等等
需要定期归档数据
参考链接：
https://segmentfault.com/a/1190000008227211
